hu.MAP 2.0: Complex View
Human Protein Complex Map
Search for a protein
Complex: HuMAP2_00875
Confidence: Medium High
Proteins| Genename | Protein Name | Links |
|---|---|---|
| KDM2A | Lysine-specific demethylase 2A (EC 1.14.11.27) (CXXC-type zinc finger protein 8) (F-box and leucine-rich repeat protein 11) (F-box protein FBL7) (F-box protein Lilina) (F-box/LRR-repeat protein 11) (JmjC domain-containing histone demethylation protein 1A) ([Histone-H3]-lysine-36 demethylase 1A) | UniProt NCBI |
| SKP1 | S-phase kinase-associated protein 1 (Cyclin-A/CDK2-associated protein p19) (p19A) (Organ of Corti protein 2) (OCP-2) (Organ of Corti protein II) (OCP-II) (RNA polymerase II elongation factor-like protein) (SIII) (Transcription elongation factor B polypeptide 1-like) (p19skp1) | UniProt NCBI |
| FBXL15 | F-box/LRR-repeat protein 15 (F-box only protein 37) | UniProt NCBI |
| FBXO7 | F-box only protein 7 | UniProt NCBI |
| ABCF3 | ATP-binding cassette sub-family F member 3 | UniProt NCBI |
| CUL1 | Cullin-1 (CUL-1) | UniProt NCBI |
Enrichments
| Term ID | Corrected Pval | Fraction Complex Coverage | Proteins | Term Name |
|---|---|---|---|---|
| CORUM:226 | 2.51655344529e-05 | 0.333333333333 | SKP1 CUL1 | Ubiquitin E3 ligase (SKP1A, SKP2, CUL1) |
| CORUM:390 | 2.51655344529e-05 | 0.333333333333 | SKP1 CUL1 | Ubiquitin E3 ligase (SKP1A, FBXW2, CUL1) |
| CORUM:615 | 2.51655344529e-05 | 0.333333333333 | SKP1 CUL1 | Ubiquitin E3 ligase (SKP1A, SKP2, CUL1) |
| CORUM:6900 | 2.51655344529e-05 | 0.333333333333 | SKP1 CUL1 | Ubiquitin E3 ligase (CUL1, FBXO10, SKP1) |
| CORUM:4072 | 2.51655344529e-05 | 0.333333333333 | SKP1 CUL1 | Ubiquitin E3 ligase (CUL1, RBX1, SKP1) |
| CORUM:2880 | 2.51655344529e-05 | 0.333333333333 | SKP1 CUL1 | Ubiquitin E3 ligase (FBXW11, SKP1, CUL1) |
| CORUM:227 | 2.51655344529e-05 | 0.333333333333 | SKP1 CUL1 | Ubiquitin E3 ligase (SKP1A, BTRC, CUL1) |
| CORUM:729 | 5.0322056017e-05 | 0.333333333333 | SKP1 CUL1 | Ubiquitin E3 ligase (FBXO31, SKP1A, CUL1, RBX1) |
| CORUM:1051 | 5.0322056017e-05 | 0.333333333333 | SKP1 CUL1 | Ubiquitin E3 ligase (SKP1A, SKP2, CUL1, RBX1) |
| CORUM:1052 | 5.0322056017e-05 | 0.333333333333 | SKP1 CUL1 | Ubiquitin E3 ligase (FBXW11, SKP1A, CUL1, RBX1) |
| CORUM:1215 | 5.0322056017e-05 | 0.333333333333 | SKP1 CUL1 | Ubiquitin E3 ligase (FBXW7, CUL1, SKP1A, RBX1) |
| CORUM:1253 | 5.0322056017e-05 | 0.333333333333 | SKP1 CUL1 | Ubiquitin E3 ligase (FBXW7, CUL1, SKP1A, RBX1) |
| CORUM:1260 | 5.0322056017e-05 | 0.333333333333 | SKP1 CUL1 | Neddylin ligase (FBXO11, SKP1, CUL1, RBX1) |
| CORUM:2191 | 5.0322056017e-05 | 0.333333333333 | SKP1 CUL1 | Ubiquitin E3 ligase (FBXO18, SKP1A, CUL1, RBX1) |
| CORUM:2192 | 5.0322056017e-05 | 0.333333333333 | SKP1 CUL1 | Ubiquitin E3 ligase (NIPA, SKP1A, CUL1, RBX1) |
| CORUM:80 | 5.0322056017e-05 | 0.333333333333 | SKP1 CUL1 | Ubiquitin E3 ligase (SKP1A, SKP2, CUL1, RBX1) |
| CORUM:2772 | 5.0322056017e-05 | 0.333333333333 | SKP1 CUL1 | Ubiquitin E3 ligase (CRY1, SKP1A, CUL1, FBXL3) |
| CORUM:2773 | 5.0322056017e-05 | 0.333333333333 | SKP1 CUL1 | Ubiquitin E3 ligase (CRY2, SKP1A, CUL1, FBXL3) |
| CORUM:2881 | 5.0322056017e-05 | 0.333333333333 | SKP1 CUL1 | Ubiquitin E3 ligase (BTRC, CUL1, RBX1, SKP1) |
| CORUM:6817 | 5.0322056017e-05 | 0.333333333333 | SKP1 CUL1 | Ubiquitin E3 ligase (FBXO18, SKP1A, CUL1, RBX1) |
| CORUM:6901 | 5.0322056017e-05 | 0.333333333333 | SKP1 CUL1 | Ubiquitin E3 ligase (CUL1, FBXO6, RBX1, SKP1) |
| CORUM:6902 | 5.0322056017e-05 | 0.333333333333 | SKP1 CUL1 | Ubiquitin E3 ligase (CUL1, FBXO17, RBX1, SKP1) |
| CORUM:6903 | 5.0322056017e-05 | 0.333333333333 | SKP1 CUL1 | Ubiquitin E3 ligase (CUL1, FBXO27, RBX1, SKP1) |
| CORUM:6904 | 5.0322056017e-05 | 0.333333333333 | SKP1 CUL1 | Ubiquitin E3 ligase (CUL1, FBXO44, RBX1, SKP1) |
| CORUM:2725 | 5.0322056017e-05 | 0.333333333333 | SKP1 CUL1 | Ubiquitin E3 ligase (NFKBIA, FBXW11, CUL1, SKP1A) |
| CORUM:2724 | 5.0322056017e-05 | 0.333333333333 | SKP1 CUL1 | Ubiquitin E3 ligase (NFKBIA, BTRC, CUL1, SKP1A) |
| CORUM:2189 | 8.38550741504e-05 | 0.333333333333 | SKP1 CUL1 | Ubiquitin E3 ligase (SMAD3, BTRC, CUL1, SKP1A, RBX1) |
| CORUM:2188 | 8.38550741504e-05 | 0.333333333333 | SKP1 CUL1 | Ubiquitin E3 ligase (CDC34, NEDD8, BTRC, CUL1, SKP1A, RBX1) |
| CORUM:3036 | 8.38550741504e-05 | 0.333333333333 | SKP1 CUL1 | Ubiquitin E3 ligase (SKP1A, SKP2, CUL1, CKS1B, RBX1) |
| GO:0019005 | 0.000115105893408 | 0.666666666667 | SKP1 FBXO7 FBXL15 CUL1 | SCF ubiquitin ligase complex |
| REAC:R-HSA-8951664 | 0.0001154175484 | 0.666666666667 | SKP1 FBXO7 FBXL15 CUL1 | Neddylation |
| REAC:R-HSA-2644607 | 0.000132982220163 | 0.333333333333 | SKP1 CUL1 | Loss of Function of FBXW7 in Cancer and NOTCH1 Signaling |
| REAC:R-HSA-2644605 | 0.000132982220163 | 0.333333333333 | SKP1 CUL1 | FBXW7 Mutants and NOTCH1 in Cancer |
| CORUM:2715 | 0.000234668084372 | 0.333333333333 | SKP1 CUL1 | Ubiquitin E3 ligase (CSN1, CSN8, HRT1, SKP1, SKP2, CUL1, CUL2, CUL3) |
| CORUM:3015 | 0.000234668084372 | 0.333333333333 | SKP1 CUL1 | p27-cyclinE-Cdk2 - Ubiquitin E3 ligase (SKP1A, SKP2, CUL1, CKS1B, RBX1) complex |
| CORUM:781 | 0.000301662071994 | 0.333333333333 | SKP1 CUL1 | URI complex (Unconventional prefoldin RPB5 Interactor) |
| REAC:R-HSA-983168 | 0.00034508144622 | 0.666666666667 | SKP1 FBXO7 FBXL15 CUL1 | Antigen processing: Ubiquitination & Proteasome degradation |
| CORUM:5196 | 0.000552750021156 | 0.333333333333 | SKP1 CUL1 | TNF-alpha/NF-kappa B signaling complex (CHUK, BTRC, NFKB2, PPP6C, REL, CUL1, IKBKE, SAPS2, SAPS1, ANKRD28, RELA, SKP1) |
| REAC:R-HSA-983169 | 0.000702192273232 | 0.666666666667 | SKP1 FBXO7 FBXL15 CUL1 | Class I MHC mediated antigen processing & presentation |
| REAC:R-HSA-1170546 | 0.0012174763081 | 0.333333333333 | SKP1 CUL1 | Prolactin receptor signaling |
| CORUM:5233 | 0.00230653586609 | 0.333333333333 | SKP1 CUL1 | TNF-alpha/NF-kappa B signaling complex 5 |
| KEGG:04710 | 0.0025298764655 | 0.333333333333 | SKP1 CUL1 | Circadian rhythm |
| REAC:R-HSA-5684264 | 0.00265393377546 | 0.333333333333 | SKP1 CUL1 | MAP3K8 (TPL2)-dependent MAPK1/3 activation |
| GO:0031461 | 0.006914256367 | 0.666666666667 | SKP1 FBXO7 FBXL15 CUL1 | cullin-RING ubiquitin ligase complex |
| REAC:R-HSA-1280218 | 0.00813952609875 | 0.666666666667 | SKP1 FBXO7 FBXL15 CUL1 | Adaptive Immune System |
| WP:WP61 | 0.00852373853417 | 0.333333333333 | SKP1 CUL1 | Notch Signaling Pathway |
| KEGG:04350 | 0.0185486461013 | 0.333333333333 | SKP1 CUL1 | TGF-beta signaling pathway |
| REAC:R-HSA-69236 | 0.0189534530409 | 0.333333333333 | SKP1 CUL1 | G1 Phase |
| REAC:R-HSA-69231 | 0.0189534530409 | 0.333333333333 | SKP1 CUL1 | Cyclin D associated events in G1 |
| REAC:R-HSA-2122947 | 0.019874448248 | 0.333333333333 | SKP1 CUL1 | NOTCH1 Intracellular Domain Regulates Transcription |
| WP:WP231 | 0.021066272601 | 0.333333333333 | SKP1 CUL1 | TNF alpha Signaling Pathway |
| REAC:R-HSA-2894858 | 0.0302745579484 | 0.333333333333 | SKP1 CUL1 | Signaling by NOTCH1 HD+PEST Domain Mutants in Cancer |
| REAC:R-HSA-9604323 | 0.0302745579484 | 0.333333333333 | SKP1 CUL1 | Negative regulation of NOTCH4 signaling |
| REAC:R-HSA-2644606 | 0.0302745579484 | 0.333333333333 | SKP1 CUL1 | Constitutive Signaling by NOTCH1 PEST Domain Mutants |
| REAC:R-HSA-2894862 | 0.0302745579484 | 0.333333333333 | SKP1 CUL1 | Constitutive Signaling by NOTCH1 HD+PEST Domain Mutants |
| REAC:R-HSA-2644603 | 0.0302745579484 | 0.333333333333 | SKP1 CUL1 | Signaling by NOTCH1 in Cancer |
| REAC:R-HSA-2644602 | 0.0302745579484 | 0.333333333333 | SKP1 CUL1 | Signaling by NOTCH1 PEST Domain Mutants in Cancer |
| REAC:R-HSA-917937 | 0.0314333263146 | 0.333333333333 | SKP1 CUL1 | Iron uptake and transport |
| REAC:R-HSA-8854050 | 0.0314333263146 | 0.333333333333 | SKP1 CUL1 | FBXL7 down-regulates AURKA during mitotic entry and in early mitosis |
| REAC:R-HSA-174113 | 0.0326136400052 | 0.333333333333 | SKP1 CUL1 | SCF-beta-TrCP mediated degradation of Emi1 |
| KEGG:04114 | 0.0348461971614 | 0.333333333333 | SKP1 CUL1 | Oocyte meiosis |
| WP:WP179 | 0.0365222779269 | 0.333333333333 | SKP1 CUL1 | Cell Cycle |
| REAC:R-HSA-5610780 | 0.0375501136505 | 0.333333333333 | SKP1 CUL1 | Degradation of GLI1 by the proteasome |
| REAC:R-HSA-5676590 | 0.0375501136505 | 0.333333333333 | SKP1 CUL1 | NIK-->noncanonical NF-kB signaling |
| REAC:R-HSA-187577 | 0.0375501136505 | 0.333333333333 | SKP1 CUL1 | SCF(Skp2)-mediated degradation of p27/p21 |
| REAC:R-HSA-5607761 | 0.0388379782234 | 0.333333333333 | SKP1 CUL1 | Dectin-1 mediated noncanonical NF-kB signaling |
| REAC:R-HSA-5610783 | 0.0388379782234 | 0.333333333333 | SKP1 CUL1 | Degradation of GLI2 by the proteasome |
| REAC:R-HSA-5610785 | 0.0388379782234 | 0.333333333333 | SKP1 CUL1 | GLI3 is processed to GLI3R by the proteasome |
| WP:WP366 | 0.0416969783243 | 0.333333333333 | SKP1 CUL1 | TGF-beta Signaling Pathway |
| REAC:R-HSA-450294 | 0.0428303754683 | 0.333333333333 | SKP1 CUL1 | MAP kinase activation |
| KEGG:04110 | 0.0437703225478 | 0.333333333333 | SKP1 CUL1 | Cell cycle |
| REAC:R-HSA-1980143 | 0.0442040700727 | 0.333333333333 | SKP1 CUL1 | Signaling by NOTCH1 |
| REAC:R-HSA-400253 | 0.0455991929544 | 0.333333333333 | SKP1 CUL1 | Circadian Clock |
| REAC:R-HSA-1169091 | 0.0470157324282 | 0.333333333333 | SKP1 CUL1 | Activation of NF-kappaB in B cells |
| REAC:R-HSA-8939902 | 0.0470157324282 | 0.333333333333 | SKP1 CUL1 | Regulation of RUNX2 expression and activity |
| CORUM:2714 | 0.0499726005494 | 0.166666666667 | CUL1 | Ubiquitin E3 ligase (CHEK1, CUL1) |
Edges
| Protein 1 | Protein 2 | Score | Precision | Evidence |
|---|---|---|---|---|
| FBXL15 | SKP1 | 0.97 | 0.881 | hein_WMM bioplex (FBXL15) bioplex_WMM hein (SKP1) |
| CUL1 | FBXO7 | 0.103 | 0.365 | hein_WMM bioplex (FBXO7) bioplex_WMM hein (CUL1,FBXO7) |
| FBXL15 | CUL1 | 0.1 | 0.361 | hein_WMM bioplex (FBXL15) bioplex_WMM |
| CUL1 | SKP1 | 0.088 | 0.353 | hein_WMM bioplex_WMM boldt youn_WMM hein (SKP1) gupta_WMM boldt_WMM |
| KDM2A | SKP1 | 0.066 | 0.348 | hein_WMM hein (SKP1) fraction |
| FBXO7 | SKP1 | 0.052 | 0.301 | hein_WMM bioplex (FBXO7) bioplex_WMM hein (FBXO7,SKP1) boldt_WMM |
| SKP1 | ABCF3 | 0.048 | 0.294 | hein_WMM youn_WMM hein (SKP1) fraction |
| FBXL15 | ABCF3 | 0.008 | 0.034 | hein_WMM WMM_only |
| FBXL15 | FBXO7 | 0.008 | 0.024 | hein_WMM WMM_only |
| FBXL15 | KDM2A | 0.007 | 0.007 | hein_WMM WMM_only |
| FBXO7 | ABCF3 | 0.007 | 0.011 | hein_WMM youn_WMM WMM_only |
| KDM2A | ABCF3 | 0.007 | 0.001 | hein_WMM WMM_only |
| FBXO7 | KDM2A | 0.007 | 0.001 | hein_WMM WMM_only |
| CUL1 | KDM2A | 0.007 | 0.005 | hein_WMM WMM_only |
| CUL1 | ABCF3 | 0.004 | 0.009 | hein_WMM youn_WMM fraction |
Images
Click to enlarge
Complex HuMAP2_00875 has an average edge precision of 0.2 which is ranked 6177 out of all 6965 complexes.
Related Complexes
| Genename | Complexes |
|---|---|
| KDM2A | HuMAP2_00875 HuMAP2_01216 HuMAP2_04602 HuMAP2_05412 |
| SKP1 | HuMAP2_00875 HuMAP2_04602 HuMAP2_05723 |
| FBXL15 | HuMAP2_00047 HuMAP2_00875 HuMAP2_01504 HuMAP2_01882 HuMAP2_04602 HuMAP2_05397 HuMAP2_05723 |
| FBXO7 | HuMAP2_00642 HuMAP2_00875 HuMAP2_05754 |
| ABCF3 | HuMAP2_00875 HuMAP2_04602 |
| CUL1 | HuMAP2_00047 HuMAP2_00875 HuMAP2_01882 HuMAP2_04602 |