hu.MAP 2.0: Complex View
Human Protein Complex Map
Search for a protein
Complex: HuMAP2_01147
Confidence: Very High
Proteins| Genename | Protein Name | Links |
|---|---|---|
| LMNB1 | Lamin-B1 | UniProt NCBI |
| LMNA | Prelamin-A/C [Cleaved into: Lamin-A/C (70 kDa lamin) (Renal carcinoma antigen NY-REN-32)] | UniProt NCBI |
| LMNB2 | Lamin-B2 | UniProt NCBI |
Enrichments
| Term ID | Corrected Pval | Fraction Complex Coverage | Proteins | Term Name |
|---|---|---|---|---|
| WP:WP314 | 7.39430675706e-07 | 1.0 | LMNA LMNB1 LMNB2 | Fas Ligand (FasL) pathway and Stress induction of Heat Shock Proteins (HSP) regulation |
| KEGG:04210 | 9.55549752694e-06 | 1.0 | LMNA LMNB1 LMNB2 | Apoptosis |
| HP:0009002 | 2.65178370278e-05 | 0.666666666667 | LMNA LMNB2 | Loss of truncal subcutaneous adipose tissue |
| CORUM:5608 | 5.03310689057e-05 | 0.666666666667 | LMNA LMNB1 | Emerin architectural complex |
| HP:0000291 | 0.00024744441095 | 0.666666666667 | LMNA LMNB2 | Abnormality of facial adipose tissue |
| CORUM:5611 | 0.000261639528628 | 0.666666666667 | LMNA LMNB1 | Emerin complex 24 |
| HP:0003635 | 0.000583157354768 | 0.666666666667 | LMNA LMNB2 | Loss of subcutaneous adipose tissue in limbs |
| HP:0005328 | 0.000689155098282 | 0.666666666667 | LMNA LMNB2 | Progeroid facial appearance |
| HP:0003676 | 0.00143712383153 | 1.0 | LMNA LMNB1 LMNB2 | Progressive |
| HP:0005339 | 0.00185475275658 | 0.666666666667 | LMNA LMNB2 | Abnormality of complement system |
| HP:0008887 | 0.00264917192674 | 0.666666666667 | LMNA LMNB2 | Adipose tissue loss |
| HP:0040063 | 0.00587799905401 | 0.666666666667 | LMNA LMNB2 | Decreased adipose tissue |
| HP:0003679 | 0.00619014428056 | 1.0 | LMNA LMNB1 LMNB2 | Pace of progression |
| HP:0000147 | 0.00873443203011 | 0.666666666667 | LMNA LMNB2 | Polycystic ovaries |
| HP:0100820 | 0.00913104209388 | 0.666666666667 | LMNA LMNB2 | Glomerulopathy |
| HP:0000138 | 0.0103735850487 | 0.666666666667 | LMNA LMNB2 | Ovarian cyst |
| HP:0000966 | 0.0116951722183 | 0.666666666667 | LMNA LMNB1 | Hypohidrosis |
| HP:0000855 | 0.0156055992881 | 0.666666666667 | LMNA LMNB2 | Insulin resistance |
| HP:0003700 | 0.0166709261154 | 0.666666666667 | LMNA LMNB2 | Generalized amyotrophy |
| WP:WP4299 | 0.0214251428905 | 0.333333333333 | LMNA | Lamin A-processing pathway |
| HP:0100578 | 0.0244499336669 | 0.666666666667 | LMNA LMNB2 | Lipoatrophy |
| HP:0003621 | 0.029972334664 | 0.666666666667 | LMNA LMNB2 | Juvenile onset |
| HP:0003130 | 0.0307019877242 | 0.666666666667 | LMNA LMNB1 | Abnormal peripheral myelination |
| HP:0001397 | 0.041834410056 | 0.666666666667 | LMNA LMNB2 | Hepatic steatosis |
| HP:0002230 | 0.0426950555564 | 0.666666666667 | LMNA LMNB2 | Generalized hirsutism |
| HP:0031065 | 0.0426950555564 | 0.666666666667 | LMNA LMNB2 | Abnormal ovarian morphology |
| HP:0001288 | 0.0432570183486 | 1.0 | LMNA LMNB1 LMNB2 | Gait disturbance |
| HPA:026020_13 | 0.0434521887131 | 0.666666666667 | LMNA LMNB1 | liver; hepatocytes[Supported,High] |
| HP:0007495 | 0.0435644243888 | 0.666666666667 | LMNA LMNB2 | Prematurely aged appearance |
| HP:0009125 | 0.0453293273008 | 0.666666666667 | LMNA LMNB2 | Lipodystrophy |
| HP:0003470 | 0.0489637608732 | 0.666666666667 | LMNA LMNB1 | Paralysis |
| HPA:013010_13 | 0.0489778207417 | 0.666666666667 | LMNA LMNB1 | endometrium 1; cells in endometrial stroma[Supported,High] |
| HP:0006561 | 0.0498941597886 | 0.666666666667 | LMNA LMNB2 | Lipid accumulation in hepatocytes |
| HP:0031137 | 0.0498941597886 | 0.666666666667 | LMNA LMNB2 | Storage in hepatocytes |
| CORUM:6091 | 0.0499776345577 | 0.333333333333 | LMNA | NF-YA-LaminA complex |
Edges
| Protein 1 | Protein 2 | Score | Precision | Evidence |
|---|---|---|---|---|
| LMNA | LMNB2 | 0.994 | 0.923 | hein_WMM bioplex (LMNA) bioplex_WMM youn_WMM hein (LMNA) gupta_WMM fraction treiber_WMM |
| LMNA | LMNB1 | 0.91 | 0.833 | hein_WMM bioplex (LMNA) bioplex_WMM youn_WMM hein (LMNA) gupta_WMM treiber_WMM |
| LMNB1 | LMNB2 | 0.064 | 0.348 | hein_WMM bioplex_WMM youn_WMM gupta_WMM fraction treiber_WMM |
Images
Click to enlarge
Complex HuMAP2_01147 has an average edge precision of 0.701 which is ranked 1364 out of all 6965 complexes.
Related Complexes
| Genename | Complexes |
|---|---|
| LMNB1 | HuMAP2_01147 HuMAP2_02463 HuMAP2_02558 |
| LMNA | HuMAP2_01147 HuMAP2_01943 HuMAP2_06899 |
| LMNB2 | HuMAP2_01147 HuMAP2_02186 HuMAP2_02630 HuMAP2_04524 HuMAP2_05795 HuMAP2_06899 |