hu.MAP 2.0: Complex View
Human Protein Complex Map
Search for a protein
Complex: HuMAP2_01177
Confidence: Medium
Proteins| Genename | Protein Name | Links |
|---|---|---|
| WDHD1 | WD repeat and HMG-box DNA-binding protein 1 (Acidic nucleoplasmic DNA-binding protein 1) (And-1) | UniProt NCBI |
| POLE | DNA polymerase epsilon catalytic subunit A (EC 2.7.7.7) (DNA polymerase II subunit A) | UniProt NCBI |
| POLA1 | DNA polymerase alpha catalytic subunit (EC 2.7.7.7) (DNA polymerase alpha catalytic subunit p180) | UniProt NCBI |
| PRIM2 | DNA primase large subunit (EC 2.7.7.-) (DNA primase 58 kDa subunit) (p58) | UniProt NCBI |
| POLA2 | DNA polymerase alpha subunit B (DNA polymerase alpha 70 kDa subunit) | UniProt NCBI |
| PRIM1 | DNA primase small subunit (EC 2.7.7.-) (DNA primase 49 kDa subunit) (p49) | UniProt NCBI |
Enrichments
| Term ID | Corrected Pval | Fraction Complex Coverage | Proteins | Term Name |
|---|---|---|---|---|
| REAC:R-HSA-174430 | 9.0230347994e-15 | 0.833333333333 | PRIM1 POLA2 PRIM2 POLA1 POLE | Telomere C-strand synthesis initiation |
| REAC:R-HSA-68952 | 9.0230347994e-15 | 0.833333333333 | PRIM1 POLA2 PRIM2 POLA1 POLE | DNA replication initiation |
| CORUM:1108 | 1.83026730483e-13 | 0.833333333333 | PRIM1 POLA2 PRIM2 POLA1 POLE | DNA synthesome complex (15 subunits) |
| CORUM:1111 | 3.77103748924e-13 | 0.833333333333 | PRIM1 POLA2 PRIM2 POLA1 POLE | DNA synthesome complex (17 subunits) |
| CORUM:1099 | 3.77103748924e-13 | 0.833333333333 | PRIM1 POLA2 PRIM2 POLA1 POLE | DNA synthesome complex (17 subunits) |
| CORUM:1100 | 4.54011687692e-13 | 0.666666666667 | POLA2 PRIM2 POLA1 PRIM1 | DNA polymerase alpha-primase complex |
| REAC:R-HSA-174417 | 6.84234945834e-12 | 0.833333333333 | PRIM1 POLA2 PRIM2 POLA1 POLE | Telomere C-strand (Lagging Strand) Synthesis |
| KEGG:03030 | 1.71274050852e-11 | 0.833333333333 | PRIM1 POLA2 PRIM2 POLA1 POLE | DNA replication |
| REAC:R-HSA-180786 | 2.29330899426e-11 | 0.833333333333 | PRIM1 POLA2 PRIM2 POLA1 POLE | Extension of Telomeres |
| WP:WP466 | 3.44835361196e-11 | 0.833333333333 | PRIM1 POLA2 PRIM2 POLA1 POLE | DNA Replication |
| REAC:R-HSA-68962 | 3.81873931614e-11 | 0.833333333333 | PRIM1 POLA2 PRIM2 POLA1 POLE | Activation of the pre-replicative complex |
| CORUM:1107 | 9.5280993066e-11 | 0.666666666667 | POLA2 PRIM2 POLA1 PRIM1 | DNA synthesome core complex |
| CORUM:1098 | 3.24304491165e-10 | 0.666666666667 | POLA2 PRIM2 POLA1 PRIM1 | DNA synthesome complex (13 subunits) |
| REAC:R-HSA-113501 | 8.57014491407e-10 | 0.666666666667 | POLA2 PRIM2 POLA1 PRIM1 | Inhibition of replication initiation of damaged DNA by RB1/E2F1 |
| WP:WP4022 | 9.1170755239e-10 | 0.833333333333 | PRIM1 POLA2 PRIM2 POLA1 POLE | Pyrimidine metabolism |
| REAC:R-HSA-69166 | 1.19969130191e-09 | 0.666666666667 | POLA2 PRIM2 POLA1 PRIM1 | Removal of the Flap Intermediate |
| REAC:R-HSA-69109 | 1.19969130191e-09 | 0.666666666667 | POLA2 PRIM2 POLA1 PRIM1 | Leading Strand Synthesis |
| REAC:R-HSA-69091 | 1.19969130191e-09 | 0.666666666667 | POLA2 PRIM2 POLA1 PRIM1 | Polymerase switching |
| REAC:R-HSA-174411 | 1.19969130191e-09 | 0.666666666667 | POLA2 PRIM2 POLA1 PRIM1 | Polymerase switching on the C-strand of the telomere |
| REAC:R-HSA-69183 | 1.63576680419e-09 | 0.666666666667 | POLA2 PRIM2 POLA1 PRIM1 | Processive synthesis on the lagging strand |
| GO:0005658 | 1.82947049513e-09 | 0.666666666667 | POLA2 PRIM2 POLA1 PRIM1 | alpha DNA polymerase:primase complex |
| GO:0032201 | 3.96312010577e-09 | 0.833333333333 | PRIM1 POLA2 PRIM2 POLA1 POLE | telomere maintenance via semi-conservative replication |
| REAC:R-HSA-157579 | 4.1114253941e-09 | 0.833333333333 | PRIM1 POLA2 PRIM2 POLA1 POLE | Telomere Maintenance |
| REAC:R-HSA-69002 | 5.26238367222e-09 | 0.833333333333 | PRIM1 POLA2 PRIM2 POLA1 POLE | DNA Replication Pre-Initiation |
| REAC:R-HSA-69186 | 5.80295251537e-09 | 0.666666666667 | POLA2 PRIM2 POLA1 PRIM1 | Lagging Strand Synthesis |
| GO:0006270 | 6.9945924325e-09 | 0.833333333333 | PRIM1 POLA2 PRIM2 POLA1 POLE | DNA replication initiation |
| REAC:R-HSA-113510 | 8.75943607526e-09 | 0.666666666667 | POLA2 PRIM2 POLA1 PRIM1 | E2F mediated regulation of DNA replication |
| GO:0006261 | 1.70651556121e-08 | 1.0 | POLA2 PRIM2 POLE PRIM1 WDHD1 POLA1 | DNA-dependent DNA replication |
| REAC:R-HSA-73886 | 1.78599987084e-08 | 0.833333333333 | PRIM1 POLA2 PRIM2 POLA1 POLE | Chromosome Maintenance |
| REAC:R-HSA-69239 | 2.80175002575e-08 | 0.833333333333 | PRIM1 POLA2 PRIM2 POLA1 POLE | Synthesis of DNA |
| GO:0043596 | 3.67598690243e-08 | 0.833333333333 | PRIM1 POLA2 PRIM2 WDHD1 POLA1 | nuclear replication fork |
| REAC:R-HSA-69306 | 3.90905948705e-08 | 0.833333333333 | PRIM1 POLA2 PRIM2 POLA1 POLE | DNA Replication |
| REAC:R-HSA-69190 | 4.30144390958e-08 | 0.666666666667 | POLA2 PRIM2 POLA1 PRIM1 | DNA strand elongation |
| REAC:R-HSA-69206 | 4.58062236292e-08 | 0.833333333333 | PRIM1 POLA2 PRIM2 POLA1 POLE | G1/S Transition |
| REAC:R-HSA-453279 | 8.53743828436e-08 | 0.833333333333 | PRIM1 POLA2 PRIM2 POLA1 POLE | Mitotic G1-G1/S phases |
| REAC:R-HSA-69242 | 1.26971687219e-07 | 0.833333333333 | PRIM1 POLA2 PRIM2 POLA1 POLE | S Phase |
| GO:0033260 | 1.27406920218e-07 | 0.833333333333 | PRIM1 POLA2 PRIM2 POLA1 POLE | nuclear DNA replication |
| WP:WP45 | 1.79003354063e-07 | 0.666666666667 | POLA2 PRIM2 PRIM1 POLE | G1 to S cell cycle control |
| GO:0044786 | 1.87214020073e-07 | 0.833333333333 | PRIM1 POLA2 PRIM2 POLA1 POLE | cell cycle DNA replication |
| GO:0006260 | 3.45239368596e-07 | 1.0 | POLA2 PRIM2 POLE PRIM1 WDHD1 POLA1 | DNA replication |
| GO:0005657 | 3.73519189534e-07 | 0.833333333333 | PRIM1 POLA2 PRIM2 WDHD1 POLA1 | replication fork |
| GO:0043601 | 4.61861792183e-06 | 0.666666666667 | POLA2 PRIM2 POLA1 PRIM1 | nuclear replisome |
| GO:0030894 | 6.40626927361e-06 | 0.666666666667 | POLA2 PRIM2 POLA1 PRIM1 | replisome |
| GO:0006269 | 7.26438828159e-06 | 0.5 | PRIM2 POLA1 PRIM1 | DNA replication, synthesis of RNA primer |
| GO:0000723 | 2.88420825293e-05 | 0.833333333333 | PRIM1 POLA2 PRIM2 POLA1 POLE | telomere maintenance |
| GO:0032200 | 4.39080435103e-05 | 0.833333333333 | PRIM1 POLA2 PRIM2 POLA1 POLE | telomere organization |
| REAC:R-HSA-69278 | 4.68016887558e-05 | 0.833333333333 | PRIM1 POLA2 PRIM2 POLA1 POLE | Cell Cycle, Mitotic |
| REAC:R-HSA-1640170 | 0.000115024964847 | 0.833333333333 | PRIM1 POLA2 PRIM2 POLA1 POLE | Cell Cycle |
| GO:0000082 | 0.000126408450622 | 0.833333333333 | PRIM1 POLA2 PRIM2 POLA1 POLE | G1/S transition of mitotic cell cycle |
| WP:WP2446 | 0.000157102141644 | 0.5 | POLE POLA1 PRIM1 | Retinoblastoma Gene in Cancer |
| GO:0044843 | 0.000169291065803 | 0.833333333333 | PRIM1 POLA2 PRIM2 POLA1 POLE | cell cycle G1/S phase transition |
| GO:0061695 | 0.000213275731053 | 0.833333333333 | PRIM1 POLA2 PRIM2 POLA1 POLE | transferase complex, transferring phosphorus-containing groups |
| CORUM:1003 | 0.000301662071994 | 0.333333333333 | POLA2 POLA1 | RC complex (Replication competent complex) |
| GO:0006259 | 0.000579923761468 | 1.0 | POLA2 PRIM2 POLE PRIM1 WDHD1 POLA1 | DNA metabolic process |
| CORUM:1005 | 0.000653133016722 | 0.333333333333 | POLE POLA1 | RC complex during G2/M-phase of cell cycle |
| CORUM:1004 | 0.000653133016722 | 0.333333333333 | POLE POLA1 | RC complex during S-phase of cell cycle |
| GO:0060249 | 0.000693957239919 | 0.833333333333 | PRIM1 POLA2 PRIM2 POLA1 POLE | anatomical structure homeostasis |
| GO:0055029 | 0.00120362941431 | 0.666666666667 | POLA2 PRIM2 POLA1 PRIM1 | nuclear DNA-directed RNA polymerase complex |
| GO:0000428 | 0.00125526288107 | 0.666666666667 | POLA2 PRIM2 POLA1 PRIM1 | DNA-directed RNA polymerase complex |
| GO:0030880 | 0.00142014462948 | 0.666666666667 | POLA2 PRIM2 POLA1 PRIM1 | RNA polymerase complex |
| GO:0000278 | 0.00149359264327 | 1.0 | POLA2 PRIM2 POLE PRIM1 WDHD1 POLA1 | mitotic cell cycle |
| GO:0016779 | 0.00216645384591 | 0.666666666667 | POLE PRIM2 POLA1 PRIM1 | nucleotidyltransferase activity |
| GO:0044454 | 0.00288133296855 | 1.0 | POLA2 PRIM2 POLE PRIM1 WDHD1 POLA1 | nuclear chromosome part |
| GO:0000228 | 0.0033810209942 | 1.0 | POLA2 PRIM2 POLE PRIM1 WDHD1 POLA1 | nuclear chromosome |
| GO:0032993 | 0.00506594708818 | 0.666666666667 | POLA2 PRIM2 POLA1 PRIM1 | protein-DNA complex |
| GO:0044772 | 0.00886141193647 | 0.833333333333 | PRIM1 POLA2 PRIM2 POLA1 POLE | mitotic cell cycle phase transition |
| CORUM:0000000 | 0.0090785708022 | 1.0 | POLA2 PRIM2 POLE PRIM1 WDHD1 POLA1 | CORUM root |
| GO:0044770 | 0.0121980983176 | 0.833333333333 | PRIM1 POLA2 PRIM2 POLA1 POLE | cell cycle phase transition |
| GO:0044427 | 0.0151552637177 | 1.0 | POLA2 PRIM2 POLE PRIM1 WDHD1 POLA1 | chromosomal part |
| GO:0005694 | 0.0188325821521 | 1.0 | POLA2 PRIM2 POLE PRIM1 WDHD1 POLA1 | chromosome |
| GO:0003896 | 0.020283420769 | 0.333333333333 | PRIM1 PRIM2 | DNA primase activity |
| GO:0006272 | 0.020283420769 | 0.333333333333 | POLE POLA1 | leading strand elongation |
| GO:0007049 | 0.0218766736595 | 1.0 | POLA2 PRIM2 POLE PRIM1 WDHD1 POLA1 | cell cycle |
| GO:0019725 | 0.0240712813761 | 0.833333333333 | PRIM1 POLA2 PRIM2 POLA1 POLE | cellular homeostasis |
Edges
| Protein 1 | Protein 2 | Score | Precision | Evidence |
|---|---|---|---|---|
| PRIM1 | POLA1 | 0.968 | 0.88 | hein_WMM bioplex (PRIM1) bioplex_WMM youn_WMM fraction |
| POLA2 | POLA1 | 0.902 | 0.826 | hein_WMM bioplex_WMM youn_WMM gupta_WMM fraction |
| PRIM1 | PRIM2 | 0.82 | 0.773 | hein_WMM bioplex (PRIM1) bioplex_WMM youn_WMM |
| PRIM1 | POLA2 | 0.644 | 0.687 | hein_WMM bioplex (PRIM1) bioplex_WMM youn_WMM fraction |
| POLE | POLA1 | 0.579 | 0.662 | bioplex_WMM youn_WMM fraction |
| POLA1 | WDHD1 | 0.029 | 0.23 | youn_WMM fraction |
| PRIM2 | POLA1 | 0.01 | 0.107 | hein_WMM bioplex_WMM youn_WMM gupta_WMM WMM_only |
| PRIM2 | POLA2 | 0.009 | 0.107 | hein_WMM bioplex_WMM youn_WMM gupta_WMM WMM_only |
| PRIM2 | WDHD1 | 0.007 | 0.006 | youn_WMM WMM_only |
| POLA2 | WDHD1 | 0.007 | 0.012 | youn_WMM WMM_only |
| POLE | PRIM2 | 0.007 | 0.005 | bioplex_WMM youn_WMM WMM_only |
| PRIM1 | WDHD1 | 0.007 | 0.005 | youn_WMM WMM_only |
| POLE | PRIM1 | 0.007 | 0.003 | bioplex_WMM youn_WMM WMM_only |
| POLE | POLA2 | 0.007 | 0.007 | bioplex_WMM youn_WMM WMM_only |
| POLE | WDHD1 | 0.005 | 0.013 | youn_WMM fraction |
Images
Click to enlarge
Complex HuMAP2_01177 has an average edge precision of 0.288 which is ranked 4770 out of all 6965 complexes.
Related Complexes