hu.MAP 2.0: Complex View
Human Protein Complex Map
Search for a protein
Complex: HuMAP2_01196
Confidence: High
Proteins| Genename | Protein Name | Links |
|---|---|---|
| RAB3GAP1 | Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit (RAB3 GTPase-activating protein 130 kDa subunit) (Rab3-GAP p130) (Rab3-GAP) | UniProt NCBI |
| SIRT2 | NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-2 (EC 3.5.1.-) (Regulatory protein SIR2 homolog 2) (SIR2-like protein 2) | UniProt NCBI |
| RAB3GAP2 | Rab3 GTPase-activating protein non-catalytic subunit (RGAP-iso) (Rab3 GTPase-activating protein 150 kDa subunit) (Rab3-GAP p150) (Rab3-GAP150) (Rab3-GAP regulatory subunit) | UniProt NCBI |
Enrichments
| Term ID | Corrected Pval | Fraction Complex Coverage | Proteins | Term Name |
|---|---|---|---|---|
| HP:0000480 | 0.00204013662007 | 0.666666666667 | RAB3GAP2 RAB3GAP1 | Retinal coloboma |
| HP:0000064 | 0.00204013662007 | 0.666666666667 | RAB3GAP2 RAB3GAP1 | Hypoplastic labia minora |
| HP:0040255 | 0.00223433522771 | 0.666666666667 | RAB3GAP2 RAB3GAP1 | Aplasia/Hypoplasia of the clitoris |
| HP:0009738 | 0.00223433522771 | 0.666666666667 | RAB3GAP2 RAB3GAP1 | Abnormality of the antihelix |
| HP:0000060 | 0.00223433522771 | 0.666666666667 | RAB3GAP2 RAB3GAP1 | Clitoral hypoplasia |
| HP:0001264 | 0.00286980764378 | 0.666666666667 | RAB3GAP2 RAB3GAP1 | Spastic diplegia |
| HP:0012880 | 0.00333750787708 | 0.666666666667 | RAB3GAP2 RAB3GAP1 | Abnormality of the labia minora |
| HP:0009465 | 0.00384043859485 | 0.666666666667 | RAB3GAP2 RAB3GAP1 | Ulnar deviation of finger |
| GO:0097051 | 0.00405722906526 | 0.666666666667 | RAB3GAP2 RAB3GAP1 | establishment of protein localization to endoplasmic reticulum membrane |
| HP:0001845 | 0.00466087105439 | 0.666666666667 | RAB3GAP2 RAB3GAP1 | Overlapping toe |
| HP:0000221 | 0.00466087105439 | 0.666666666667 | RAB3GAP2 RAB3GAP1 | Furrowed tongue |
| HP:0001193 | 0.0068832170429 | 0.666666666667 | RAB3GAP2 RAB3GAP1 | Ulnar deviation of the hand or of fingers of the hand |
| GO:1903373 | 0.00811409485621 | 0.666666666667 | RAB3GAP2 RAB3GAP1 | positive regulation of endoplasmic reticulum tubular network organization |
| GO:0050747 | 0.00811409485621 | 0.666666666667 | RAB3GAP2 RAB3GAP1 | positive regulation of lipoprotein metabolic process |
| GO:1903061 | 0.00811409485621 | 0.666666666667 | RAB3GAP2 RAB3GAP1 | positive regulation of protein lipidation |
| REAC:R-HSA-6811436 | 0.00818423736949 | 0.666666666667 | RAB3GAP2 RAB3GAP1 | COPI-independent Golgi-to-ER retrograde traffic |
| HP:0000066 | 0.00834660940556 | 0.666666666667 | RAB3GAP2 RAB3GAP1 | Labial hypoplasia |
| HP:0012815 | 0.00913104209388 | 0.666666666667 | RAB3GAP2 RAB3GAP1 | Hypoplastic female external genitalia |
| HP:0000649 | 0.0103735850487 | 0.666666666667 | RAB3GAP2 RAB3GAP1 | Abnormality of visual evoked potentials |
| GO:1903059 | 0.0135228859698 | 0.666666666667 | RAB3GAP2 RAB3GAP1 | regulation of protein lipidation |
| GO:1903371 | 0.0135228859698 | 0.666666666667 | RAB3GAP2 RAB3GAP1 | regulation of endoplasmic reticulum tubular network organization |
| HP:0000058 | 0.0161338784795 | 0.666666666667 | RAB3GAP2 RAB3GAP1 | Abnormality of the labia |
| HP:0030141 | 0.0218987389569 | 0.666666666667 | RAB3GAP2 RAB3GAP1 | Abnormality of the posterior hairline |
| HP:0000056 | 0.0218987389569 | 0.666666666667 | RAB3GAP2 RAB3GAP1 | Abnormality of the clitoris |
| HP:0002162 | 0.0218987389569 | 0.666666666667 | RAB3GAP2 RAB3GAP1 | Low posterior hairline |
| HP:0000519 | 0.0237990042853 | 0.666666666667 | RAB3GAP2 RAB3GAP1 | Developmental cataract |
| REAC:R-HSA-8876198 | 0.0238137546255 | 0.666666666667 | RAB3GAP2 RAB3GAP1 | RAB GEFs exchange GTP for GDP on RABs |
| HP:0000601 | 0.0257780467151 | 0.666666666667 | RAB3GAP2 RAB3GAP1 | Hypotelorism |
| HP:0000044 | 0.0368537935068 | 0.666666666667 | RAB3GAP2 RAB3GAP1 | Hypogonadotrophic hypogonadism |
| GO:0050746 | 0.0378589948753 | 0.666666666667 | RAB3GAP2 RAB3GAP1 | regulation of lipoprotein metabolic process |
| GO:2000786 | 0.0378589948753 | 0.666666666667 | RAB3GAP2 RAB3GAP1 | positive regulation of autophagosome assembly |
| HP:0000232 | 0.041834410056 | 0.666666666667 | RAB3GAP2 RAB3GAP1 | Everted lower lip vermilion |
| HP:0002230 | 0.0426950555564 | 0.666666666667 | RAB3GAP2 RAB3GAP1 | Generalized hirsutism |
| HP:0007495 | 0.0435644243888 | 0.666666666667 | RAB3GAP2 RAB3GAP1 | Prematurely aged appearance |
| REAC:R-HSA-9007101 | 0.0444303896492 | 0.666666666667 | RAB3GAP2 RAB3GAP1 | Rab regulation of trafficking |
| HP:0012472 | 0.0480420769795 | 0.666666666667 | RAB3GAP2 RAB3GAP1 | Eclabion |
| HP:0008388 | 0.0498941597886 | 0.666666666667 | RAB3GAP2 RAB3GAP1 | Abnormal toenail morphology |
Edges
| Protein 1 | Protein 2 | Score | Precision | Evidence |
|---|---|---|---|---|
| RAB3GAP1 | SIRT2 | 0.826 | 0.774 | bioplex (SIRT2) bioplex_WMM youn_WMM |
| SIRT2 | RAB3GAP2 | 0.69 | 0.715 | bioplex (SIRT2) bioplex_WMM youn_WMM gupta_WMM |
| RAB3GAP1 | RAB3GAP2 | 0.0 | 0.003 | bioplex_WMM youn_WMM Malo gupta_WMM fraction |
Images
Click to enlarge
Complex HuMAP2_01196 has an average edge precision of 0.497 which is ranked 2515 out of all 6965 complexes.
Related Complexes
| Genename | Complexes |
|---|---|
| RAB3GAP1 | HuMAP2_01070 HuMAP2_01196 HuMAP2_03258 HuMAP2_05816 HuMAP2_05846 HuMAP2_06645 |
| SIRT2 | HuMAP2_01196 HuMAP2_03258 HuMAP2_05816 HuMAP2_05846 HuMAP2_05876 HuMAP2_06645 |
| RAB3GAP2 | HuMAP2_01196 HuMAP2_05816 HuMAP2_05846 HuMAP2_06645 |