hu.MAP 2.0: Complex View

Human Protein Complex Map

Complex: HuMAP2_01893

Confidence: Medium

Genename	Protein Name	Links
PDGFRB	Platelet-derived growth factor receptor beta (PDGF-R-beta) (PDGFR-beta) (EC 2.7.10.1) (Beta platelet-derived growth factor receptor) (Beta-type platelet-derived growth factor receptor) (CD140 antigen-like family member B) (Platelet-derived growth factor receptor 1) (PDGFR-1) (CD antigen CD140b)	UniProt NCBI
PDGFRA	Platelet-derived growth factor receptor alpha (PDGF-R-alpha) (PDGFR-alpha) (EC 2.7.10.1) (Alpha platelet-derived growth factor receptor) (Alpha-type platelet-derived growth factor receptor) (CD140 antigen-like family member A) (CD140a antigen) (Platelet-derived growth factor alpha receptor) (Platelet-derived growth factor receptor 2) (PDGFR-2) (CD antigen CD140a)	UniProt NCBI
DEPDC1	DEP domain-containing protein 1A	UniProt NCBI

Enrichments

Term ID	Corrected Pval	Fraction Complex Coverage	Proteins	Term Name
WP:WP322	4.31484851616e-05	0.666666666667	PDGFRA PDGFRB	Osteoblast Signaling
WP:WP3640	0.000146652290714	0.666666666667	PDGFRA PDGFRB	Imatinib and Chronic Myeloid Leukemia
HP:0005547	0.000318128568027	0.666666666667	PDGFRA PDGFRB	Myeloproliferative disorder
KEGG:05218	0.000844586654193	0.666666666667	PDGFRA PDGFRB	Melanoma
KEGG:05230	0.000987288198645	0.666666666667	PDGFRA PDGFRB	Central carbon metabolism in cancer
KEGG:05214	0.00101716035293	0.666666666667	PDGFRA PDGFRB	Glioma
KEGG:01521	0.00120571114426	0.666666666667	PDGFRA PDGFRB	EGFR tyrosine kinase inhibitor resistance
GO:0072277	0.00135247023414	0.666666666667	PDGFRA PDGFRB	metanephric glomerular capillary formation
GO:0072276	0.00135247023414	0.666666666667	PDGFRA PDGFRB	metanephric glomerulus vasculature morphogenesis
GO:0072275	0.00135247023414	0.666666666667	PDGFRA PDGFRB	metanephric glomerulus morphogenesis
GO:0005017	0.00135247023414	0.666666666667	PDGFRA PDGFRB	platelet-derived growth factor-activated receptor activity
WP:WP4538	0.00147359516221	0.666666666667	PDGFRA PDGFRB	Regulatory circuits of the STAT3 signaling pathway
KEGG:04540	0.00155543182841	0.666666666667	PDGFRA PDGFRB	Gap junction
KEGG:05231	0.00174690264746	0.666666666667	PDGFRA PDGFRB	Choline metabolism in cancer
KEGG:05215	0.00178652468712	0.666666666667	PDGFRA PDGFRB	Prostate cancer
REAC:R-HSA-186763	0.00234745427481	0.666666666667	PDGFRA PDGFRB	Downstream signal transduction
WP:WP4018	0.00302048413579	0.666666666667	PDGFRA PDGFRB	Pathways in clear cell renal cell carcinoma
WP:WP2261	0.00317409068183	0.666666666667	PDGFRA PDGFRB	Signaling Pathways in Glioblastoma
KEGG:04630	0.00323398213006	0.666666666667	PDGFRA PDGFRB	JAK-STAT signaling pathway
KEGG:04072	0.00350714576187	0.666666666667	PDGFRA PDGFRB	Phospholipase D signaling pathway
WP:WP4540	0.00357470816736	0.666666666667	PDGFRA PDGFRB	Pathways Regulating Hippo Signaling
GO:0038086	0.00405722906526	0.666666666667	PDGFRA PDGFRB	VEGF-activated platelet-derived growth factor receptor signaling pathway
GO:0038091	0.00405722906526	0.666666666667	PDGFRA PDGFRB	positive regulation of cell proliferation by VEGF-activated platelet derived growth factor receptor signaling pathway
GO:0072103	0.00405722906526	0.666666666667	PDGFRA PDGFRB	glomerulus vasculature morphogenesis
GO:0072104	0.00405722906526	0.666666666667	PDGFRA PDGFRB	glomerular capillary formation
WP:WP3931	0.00453947853799	0.666666666667	PDGFRA PDGFRB	ESC Pluripotency Pathways
WP:WP4541	0.00491871423903	0.666666666667	PDGFRA PDGFRB	Hippo-Merlin Signaling Dysregulation
KEGG:05206	0.00544616782939	0.666666666667	PDGFRA PDGFRB	MicroRNAs in cancer
KEGG:04020	0.00558575423654	0.666666666667	PDGFRA PDGFRB	Calcium signaling pathway
HP:0001880	0.00620427636329	0.666666666667	PDGFRA PDGFRB	Eosinophilia
HP:0020064	0.00620427636329	0.666666666667	PDGFRA PDGFRB	Abnormal eosinophil count
KEGG:04015	0.0066119256567	0.666666666667	PDGFRA PDGFRB	Rap1 signaling pathway
REAC:R-HSA-2219530	0.00661568366637	0.666666666667	PDGFRA PDGFRB	Constitutive Signaling by Aberrant PI3K in Cancer
HP:0001879	0.0068832170429	0.666666666667	PDGFRA PDGFRB	Abnormal eosinophil morphology
KEGG:04014	0.00747836674868	0.666666666667	PDGFRA PDGFRB	Ras signaling pathway
KEGG:04810	0.00772384569084	0.666666666667	PDGFRA PDGFRB	Regulation of actin cytoskeleton
KEGG:04510	0.0078896816737	0.666666666667	PDGFRA PDGFRB	Focal adhesion
GO:0072239	0.00811409485621	0.666666666667	PDGFRA PDGFRB	metanephric glomerulus vasculature development
GO:0061439	0.00811409485621	0.666666666667	PDGFRA PDGFRB	kidney vasculature morphogenesis
GO:0061438	0.00811409485621	0.666666666667	PDGFRA PDGFRB	renal system vasculature morphogenesis
WP:WP51	0.0082449684177	0.666666666667	PDGFRA PDGFRB	Regulation of Actin Cytoskeleton
REAC:R-HSA-186797	0.00955880978777	0.666666666667	PDGFRA PDGFRB	Signaling by PDGF
HP:0005214	0.0108053329976	0.666666666667	PDGFRA PDGFRB	Intestinal obstruction
WP:WP4223	0.0113696258401	0.666666666667	PDGFRA PDGFRB	Ras Signaling
GO:0072102	0.0135228859698	0.666666666667	PDGFRA PDGFRB	glomerulus morphogenesis
KEGG:04010	0.0144512154105	0.666666666667	PDGFRA PDGFRB	MAPK signaling pathway
HP:0004796	0.0150860897283	0.666666666667	PDGFRA PDGFRB	Gastrointestinal obstruction
REAC:R-HSA-6811558	0.015660289467	0.666666666667	PDGFRA PDGFRB	PI5P, PP2A and IER3 Regulate PI3K/AKT Signaling
REAC:R-HSA-2219528	0.0165866686159	0.666666666667	PDGFRA PDGFRB	PI3K/AKT Signaling in Cancer
WP:WP306	0.0167204021762	0.666666666667	PDGFRA PDGFRB	Focal Adhesion
REAC:R-HSA-199418	0.0190186686906	0.666666666667	PDGFRA PDGFRB	Negative regulation of the PI3K/AKT network
KEGG:04151	0.0198175756043	0.666666666667	PDGFRA PDGFRB	PI3K-Akt signaling pathway
GO:0038085	0.020283420769	0.666666666667	PDGFRA PDGFRB	vascular endothelial growth factor binding
GO:0072224	0.020283420769	0.666666666667	PDGFRA PDGFRB	metanephric glomerulus development
WP:WP3932	0.0309522486098	0.666666666667	PDGFRA PDGFRB	Focal Adhesion-PI3K-Akt-mTOR-signaling pathway
HP:0001974	0.0360542445711	0.666666666667	PDGFRA PDGFRB	Leukocytosis
WP:WP4172	0.0388642175144	0.666666666667	PDGFRA PDGFRB	PI3K-Akt Signaling Pathway
KEGG:05200	0.0473113658041	0.666666666667	PDGFRA PDGFRB	Pathways in cancer
GO:0061298	0.0486736709081	0.666666666667	PDGFRA PDGFRB	retina vasculature development in camera-type eye
HP:0100242	0.0489637608732	0.666666666667	PDGFRA PDGFRB	Sarcoma
CORUM:6413	0.0499776345577	0.333333333333	PDGFRB	PDGFB-PDGFRB complex
CORUM:3183	0.0499776345577	0.333333333333	PDGFRA	PDGFRA-SHP-2 complex, PDGF stimulated

Edges

Protein 1	Protein 2	Score	Precision	Evidence
DEPDC1	PDGFRB	0.08	0.35	bioplex (PDGFRB) bioplex_WMM
PDGFRB	PDGFRA	0.033	0.253	bioplex (PDGFRB) bioplex_WMM
DEPDC1	PDGFRA	0.008	0.06	bioplex_WMM WMM_only

Images

Click to enlarge

Complex HuMAP2_01893 has an average edge precision of 0.221 which is ranked 5840 out of all 6965 complexes.

Related Complexes

Genename	Complexes
PDGFRB	HuMAP2_01557 HuMAP2_01643 HuMAP2_01893
PDGFRA	HuMAP2_01643 HuMAP2_01893
DEPDC1	HuMAP2_00240 HuMAP2_00717 HuMAP2_01557 HuMAP2_01643 HuMAP2_01893

hu.MAP 2.0: Complex View

Search for a protein

Complex: HuMAP2_01893