hu.MAP 2.0: Complex View
Human Protein Complex Map
Search for a protein
Complex: HuMAP2_02785
Confidence: Very High
Proteins| Genename | Protein Name | Links |
|---|---|---|
| APTX | Aprataxin (EC 3.1.11.7) (EC 3.1.12.2) (Forkhead-associated domain histidine triad-like protein) (FHA-HIT) | UniProt NCBI |
| LIG4 | DNA ligase 4 (EC 6.5.1.1) (DNA ligase IV) (Polydeoxyribonucleotide synthase [ATP] 4) | UniProt NCBI |
| XRCC4 | DNA repair protein XRCC4 (X-ray repair cross-complementing protein 4) | UniProt NCBI |
Enrichments
| Term ID | Corrected Pval | Fraction Complex Coverage | Proteins | Term Name |
|---|---|---|---|---|
| CORUM:354 | 3.35600554376e-06 | 0.666666666667 | LIG4 XRCC4 | DNA ligase IV-XRCC4 complex |
| CORUM:345 | 3.35600554376e-06 | 0.666666666667 | LIG4 XRCC4 | DNA ligase IV-XRCC4 complex |
| CORUM:344 | 3.35600554376e-06 | 0.666666666667 | LIG4 XRCC4 | DNA ligase IV-XRCC4 complex |
| CORUM:352 | 3.35600554376e-06 | 0.666666666667 | LIG4 XRCC4 | DNA ligase IV-XRCC4 complex |
| CORUM:206 | 3.35600554376e-06 | 0.666666666667 | LIG4 XRCC4 | DNA ligase IV-XRCC4 complex |
| CORUM:348 | 3.35600554376e-06 | 0.666666666667 | LIG4 XRCC4 | DNA ligase IV-XRCC4 complex |
| CORUM:336 | 1.00675659188e-05 | 0.666666666667 | LIG4 XRCC4 | DNA ligase IV-XRCC4-AHNK complex |
| CORUM:359 | 1.00675659188e-05 | 0.666666666667 | LIG4 XRCC4 | DNA ligase IV-XRCC4-XLF complex |
| CORUM:350 | 1.00675659188e-05 | 0.666666666667 | LIG4 XRCC4 | DNA ligase IV-XRCC4-PNK complex |
| KEGG:03450 | 3.49141490189e-05 | 0.666666666667 | LIG4 XRCC4 | Non-homologous end-joining |
| CORUM:1189 | 7.04603414803e-05 | 0.666666666667 | LIG4 XRCC4 | DNA double-strand break end-joining complex |
| REAC:R-HSA-164843 | 0.000140571869389 | 0.666666666667 | LIG4 XRCC4 | 2-LTR circle formation |
| REAC:R-HSA-162592 | 0.000240958766872 | 0.666666666667 | LIG4 XRCC4 | Integration of provirus |
| HP:0000320 | 0.000583157354768 | 0.666666666667 | LIG4 XRCC4 | Bird-like facies |
| REAC:R-HSA-162594 | 0.00060895383853 | 0.666666666667 | LIG4 XRCC4 | Early Phase of HIV Life Cycle |
| HP:0003683 | 0.000689155098282 | 0.666666666667 | LIG4 XRCC4 | Large beaked nose |
| HP:0004430 | 0.000927625684184 | 0.666666666667 | LIG4 XRCC4 | Severe combined immunodeficiency |
| HP:0005387 | 0.00120138848745 | 0.666666666667 | LIG4 XRCC4 | Combined immunodeficiency |
| GO:0032807 | 0.00405722906526 | 0.666666666667 | LIG4 XRCC4 | DNA ligase IV complex |
| HP:0003220 | 0.00620427636329 | 0.666666666667 | LIG4 XRCC4 | Abnormality of chromosome stability |
| GO:0005958 | 0.00811409485621 | 0.666666666667 | LIG4 XRCC4 | DNA-dependent protein kinase-DNA ligase 4 complex |
| GO:0033152 | 0.00811409485621 | 0.666666666667 | LIG4 XRCC4 | immunoglobulin V(D)J recombination |
| HP:0000294 | 0.0145753509873 | 0.666666666667 | LIG4 XRCC4 | Low anterior hairline |
| HP:0100585 | 0.0156055992881 | 0.666666666667 | LIG4 XRCC4 | Telangiectasia of the skin |
| HP:0004422 | 0.0156055992881 | 0.666666666667 | LIG4 XRCC4 | Biparietal narrowing |
| REAC:R-HSA-5693571 | 0.015660289467 | 0.666666666667 | LIG4 XRCC4 | Nonhomologous End-Joining (NHEJ) |
| HP:0000992 | 0.0244499336669 | 0.666666666667 | LIG4 XRCC4 | Cutaneous photosensitivity |
| HP:0000601 | 0.0257780467151 | 0.666666666667 | LIG4 XRCC4 | Hypotelorism |
| HP:0002488 | 0.0292514239306 | 0.666666666667 | LIG4 XRCC4 | Acute leukemia |
| HP:0001876 | 0.0307019877242 | 0.666666666667 | LIG4 XRCC4 | Pancytopenia |
| HP:0000599 | 0.0344813463748 | 0.666666666667 | LIG4 XRCC4 | Abnormality of the frontal hairline |
| HP:0002665 | 0.0344813463748 | 0.666666666667 | LIG4 XRCC4 | Lymphoma |
| HP:0001974 | 0.0360542445711 | 0.666666666667 | LIG4 XRCC4 | Leukocytosis |
| GO:0051103 | 0.0378589948753 | 0.666666666667 | LIG4 XRCC4 | DNA ligation involved in DNA repair |
| GO:0075713 | 0.0378589948753 | 0.666666666667 | LIG4 XRCC4 | establishment of integrated proviral latency |
| HP:0010783 | 0.0401392937999 | 0.666666666667 | LIG4 XRCC4 | Erythema |
| HP:0000639 | 0.04291596551 | 1.0 | APTX XRCC4 LIG4 | Nystagmus |
| HP:0012547 | 0.0446392984448 | 1.0 | APTX XRCC4 LIG4 | Abnormal involuntary eye movements |
| HP:0001009 | 0.0480420769795 | 0.666666666667 | LIG4 XRCC4 | Telangiectasia |
| GO:0033151 | 0.0486736709081 | 0.666666666667 | LIG4 XRCC4 | V(D)J recombination |
| GO:0019043 | 0.0486736709081 | 0.666666666667 | LIG4 XRCC4 | establishment of viral latency |
| GO:0070419 | 0.0486736709081 | 0.666666666667 | LIG4 XRCC4 | nonhomologous end joining complex |
| CORUM:213 | 0.0499776345577 | 0.333333333333 | LIG4 | DNA ligase IV-XRCC1 complex |
| WP:WP438 | 0.0499785733994 | 0.333333333333 | XRCC4 | Non-homologous end joining |
Edges
| Protein 1 | Protein 2 | Score | Precision | Evidence |
|---|---|---|---|---|
| XRCC4 | LIG4 | 1.0 | 0.949 | hein_WMM bioplex (XRCC4) bioplex_WMM |
| APTX | XRCC4 | 1.0 | 0.949 | bioplex (XRCC4) bioplex_WMM |
| APTX | LIG4 | 0.009 | 0.093 | bioplex_WMM WMM_only |
Images
Click to enlarge
Complex HuMAP2_02785 has an average edge precision of 0.664 which is ranked 1561 out of all 6965 complexes.
Related Complexes