hu.MAP 2.0: Complex View
Human Protein Complex Map
Search for a protein
Complex: HuMAP2_02955
Confidence: Medium High
Proteins| Genename | Protein Name | Links |
|---|---|---|
| RAPGEF1 | Rap guanine nucleotide exchange factor 1 (CRK SH3-binding GNRP) (Guanine nucleotide-releasing factor 2) (Protein C3G) | UniProt NCBI |
| PRAG1 | Inactive tyrosine-protein kinase PRAG1 (PEAK1-related kinase-activating pseudokinase 1) (Pragmin) (Sugen kinase 223) (SgK223) | UniProt NCBI |
| CRKL | Crk-like protein | UniProt NCBI |
Enrichments
| Term ID | Corrected Pval | Fraction Complex Coverage | Proteins | Term Name |
|---|---|---|---|---|
| CORUM:2476 | 2.01342304124e-05 | 0.666666666667 | RAPGEF1 CRKL | CRKL-PDGFRA-CRK-RAPGEF1 complex |
| REAC:R-HSA-170968 | 0.000187420766709 | 0.666666666667 | RAPGEF1 CRKL | Frs2-mediated activation |
| REAC:R-HSA-8875555 | 0.000301184970683 | 0.666666666667 | RAPGEF1 CRKL | MET activates RAP1 and RAC1 |
| REAC:R-HSA-169893 | 0.000368098478948 | 0.666666666667 | RAPGEF1 CRKL | Prolonged ERK activation events |
| REAC:R-HSA-9027284 | 0.000521983812065 | 0.666666666667 | RAPGEF1 CRKL | Erythropoietin activates RAS |
| WP:WP313 | 0.000537339634491 | 0.666666666667 | RAPGEF1 CRKL | Signaling of Hepatocyte Growth Factor Receptor |
| WP:WP286 | 0.000824391260345 | 0.666666666667 | RAPGEF1 CRKL | IL-3 Signaling Pathway |
| KEGG:05211 | 0.00087223886567 | 0.666666666667 | RAPGEF1 CRKL | Renal cell carcinoma |
| REAC:R-HSA-912631 | 0.00127110038679 | 0.666666666667 | RAPGEF1 CRKL | Regulation of signaling by CBL |
| GO:0046579 | 0.00128871559377 | 1.0 | RAPGEF1 PRAG1 CRKL | positive regulation of Ras protein signal transduction |
| WP:WP585 | 0.00136941813981 | 0.666666666667 | RAPGEF1 CRKL | Interferon type I signaling pathways |
| GO:0051057 | 0.00137862598403 | 1.0 | RAPGEF1 PRAG1 CRKL | positive regulation of small GTPase mediated signal transduction |
| WP:WP4205 | 0.00152711190824 | 0.666666666667 | RAPGEF1 CRKL | MET in type 1 papillary renal cell carcinoma |
| REAC:R-HSA-9006335 | 0.00169234301901 | 0.666666666667 | RAPGEF1 CRKL | Signaling by Erythropoietin |
| REAC:R-HSA-186763 | 0.00234745427481 | 0.666666666667 | RAPGEF1 CRKL | Downstream signal transduction |
| KEGG:04722 | 0.00252775047936 | 0.666666666667 | RAPGEF1 CRKL | Neurotrophin signaling pathway |
| REAC:R-HSA-187687 | 0.00271504560844 | 0.666666666667 | RAPGEF1 CRKL | Signalling to ERKs |
| KEGG:04910 | 0.00345163215546 | 0.666666666667 | RAPGEF1 CRKL | Insulin signaling pathway |
| WP:WP23 | 0.00365767654025 | 0.666666666667 | RAPGEF1 CRKL | B Cell Receptor Signaling Pathway |
| REAC:R-HSA-512988 | 0.00445214779833 | 0.666666666667 | RAPGEF1 CRKL | Interleukin-3, Interleukin-5 and GM-CSF signaling |
| REAC:R-HSA-8875878 | 0.00445214779833 | 0.666666666667 | RAPGEF1 CRKL | MET promotes cell motility |
| KEGG:04015 | 0.0066119256567 | 0.666666666667 | RAPGEF1 CRKL | Rap1 signaling pathway |
| KEGG:04510 | 0.0078896816737 | 0.666666666667 | RAPGEF1 CRKL | Focal adhesion |
| REAC:R-HSA-186797 | 0.00955880978777 | 0.666666666667 | RAPGEF1 CRKL | Signaling by PDGF |
| MIRNA:hsa-miR-6744-5p | 0.0155057401397 | 0.666666666667 | RAPGEF1 CRKL | hsa-miR-6744-5p |
| WP:WP306 | 0.0167204021762 | 0.666666666667 | RAPGEF1 CRKL | Focal Adhesion |
| REAC:R-HSA-6806834 | 0.0175395775792 | 0.666666666667 | RAPGEF1 CRKL | Signaling by MET |
| REAC:R-HSA-187037 | 0.0175395775792 | 0.666666666667 | RAPGEF1 CRKL | Signaling by NTRK1 (TRKA) |
| GO:0046578 | 0.0190659069388 | 1.0 | RAPGEF1 PRAG1 CRKL | regulation of Ras protein signal transduction |
| MIRNA:hsa-miR-541-5p | 0.0264402587388 | 0.666666666667 | RAPGEF1 CRKL | hsa-miR-541-5p |
| REAC:R-HSA-166520 | 0.0273084129672 | 0.666666666667 | RAPGEF1 CRKL | Signaling by NTRKs |
| MIRNA:hsa-miR-1255a | 0.0402634668291 | 0.666666666667 | RAPGEF1 CRKL | hsa-miR-1255a |
| MIRNA:hsa-miR-1255b-5p | 0.0402634668291 | 0.666666666667 | RAPGEF1 CRKL | hsa-miR-1255b-5p |
| CORUM:5444 | 0.0499776345577 | 0.333333333333 | RAPGEF1 | CRKII-C3G complex |
Edges
| Protein 1 | Protein 2 | Score | Precision | Evidence |
|---|---|---|---|---|
| CRKL | PRAG1 | 0.073 | 0.355 | hein_WMM hein (CRKL) |
| RAPGEF1 | CRKL | 0.051 | 0.298 | hein_WMM hein (CRKL) gupta_WMM |
| RAPGEF1 | PRAG1 | 0.008 | 0.062 | hein_WMM WMM_only |
Images
Click to enlarge
Complex HuMAP2_02955 has an average edge precision of 0.238 which is ranked 5556 out of all 6965 complexes.
Related Complexes
| Genename | Complexes |
|---|---|
| RAPGEF1 | HuMAP2_02955 HuMAP2_05575 |
| PRAG1 | HuMAP2_02955 HuMAP2_05575 |
| CRKL | HuMAP2_02955 HuMAP2_05575 |