hu.MAP 2.0: Complex View

Human Protein Complex Map

Complex: HuMAP2_03411

Confidence: Medium

Genename	Protein Name	Links
ERCC4	DNA repair endonuclease XPF (EC 3.1.-.-) (DNA excision repair protein ERCC-4) (DNA repair protein complementing XP-F cells) (Xeroderma pigmentosum group F-complementing protein)	UniProt NCBI
XPA	DNA repair protein complementing XP-A cells (Xeroderma pigmentosum group A-complementing protein)	UniProt NCBI
NUP43	Nucleoporin Nup43 (Nup107-160 subcomplex subunit Nup43) (p42)	UniProt NCBI

Enrichments

Term ID	Corrected Pval	Fraction Complex Coverage	Proteins	Term Name
CORUM:531	1.00675659188e-05	0.666666666667	XPA ERCC4	XPA-ERCC1-ERCC4 complex
HP:0010649	0.00024744441095	0.666666666667	XPA ERCC4	Flat nasal alae
KEGG:03420	0.000422858026176	0.666666666667	XPA ERCC4	Nucleotide excision repair
HP:0009755	0.000583157354768	0.666666666667	XPA ERCC4	Ankyloblepharon
HP:0003079	0.000583157354768	0.666666666667	XPA ERCC4	Defective DNA repair after ultraviolet radiation damage
HP:0001029	0.000803978270478	0.666666666667	XPA ERCC4	Poikiloderma
HP:0003254	0.000927625684184	0.666666666667	XPA ERCC4	Abnormality of DNA repair
GO:1901255	0.00135247023414	0.666666666667	XPA ERCC4	nucleotide-excision repair involved in interstrand cross-link repair
HP:0000621	0.0015104340107	0.666666666667	XPA ERCC4	Entropion
HP:0000524	0.0015104340107	0.666666666667	XPA ERCC4	Conjunctival telangiectasia
HP:0008054	0.00204013662007	0.666666666667	XPA ERCC4	Abnormal morphology of the conjunctival vasculature
HP:0004493	0.00286980764378	0.666666666667	XPA ERCC4	Craniofacial hyperostosis
HP:0001059	0.00309925335629	0.666666666667	XPA ERCC4	Pterygium
GO:0000110	0.00405722906526	0.666666666667	XPA ERCC4	nucleotide-excision repair factor 1 complex
HP:0100579	0.00437859029972	0.666666666667	XPA ERCC4	Mucosal telangiectasiae
REAC:R-HSA-5696400	0.00548064029679	0.666666666667	XPA ERCC4	Dual Incision in GG-NER
HP:0100012	0.00556051868131	0.666666666667	XPA ERCC4	Neoplasm of the eye
HP:0012740	0.00587799905401	0.666666666667	XPA ERCC4	Papilloma
REAC:R-HSA-5696395	0.00603484671946	0.666666666667	XPA ERCC4	Formation of Incision Complex in GG-NER
HP:0004437	0.0068832170429	0.666666666667	XPA ERCC4	Cranial hyperostosis
HP:0001480	0.0072358780389	0.666666666667	XPA ERCC4	Freckling
HP:0000498	0.00759733122278	0.666666666667	XPA ERCC4	Blepharitis
HP:0006887	0.00913104209388	0.666666666667	XPA ERCC4	Intellectual disability, progressive
HP:0100774	0.00913104209388	0.666666666667	XPA ERCC4	Hyperostosis
HP:0000995	0.00953643840968	0.666666666667	XPA ERCC4	Melanocytic nevus
HP:0000656	0.0112458624499	0.666666666667	XPA ERCC4	Ectropion
REAC:R-HSA-6782135	0.0138871493871	0.666666666667	XPA ERCC4	Dual incision in TC-NER
HP:0002861	0.0145753509873	0.666666666667	XPA ERCC4	Melanoma
HP:0000491	0.0156055992881	0.666666666667	XPA ERCC4	Keratitis
HP:0100585	0.0156055992881	0.666666666667	XPA ERCC4	Telangiectasia of the skin
HP:0001034	0.0166709261154	0.666666666667	XPA ERCC4	Hypermelanotic macule
HP:0007759	0.0183346678183	0.666666666667	XPA ERCC4	Opacification of the corneal stroma
HP:0004334	0.0194876494112	0.666666666667	XPA ERCC4	Dermal atrophy
REAC:R-HSA-6781827	0.0200378707185	0.666666666667	XPA ERCC4	Transcription-Coupled Nucleotide Excision Repair (TC-NER)
HP:0000963	0.0200772827833	0.666666666667	XPA ERCC4	Thin skin
HP:0011492	0.0200772827833	0.666666666667	XPA ERCC4	Abnormality of corneal stroma
REAC:R-HSA-5696399	0.0232544758505	0.666666666667	XPA ERCC4	Global Genome Nucleotide Excision Repair (GG-NER)
HP:0000992	0.0244499336669	0.666666666667	XPA ERCC4	Cutaneous photosensitivity
HP:0011495	0.0307019877242	0.666666666667	XPA ERCC4	Abnormal corneal epithelium morphology
HP:0012733	0.0384790851177	0.666666666667	XPA ERCC4	Macule
REAC:R-HSA-5696398	0.0399448421955	0.666666666667	XPA ERCC4	Nucleotide Excision Repair
HP:0010783	0.0401392937999	0.666666666667	XPA ERCC4	Erythema
HP:0008734	0.0435644243888	0.666666666667	XPA ERCC4	Decreased testicular size
HP:0003764	0.0435644243888	0.666666666667	XPA ERCC4	Nevus
HP:0001053	0.0480420769795	0.666666666667	XPA ERCC4	Hypopigmented skin patches
HP:0001009	0.0480420769795	0.666666666667	XPA ERCC4	Telangiectasia

Edges

Protein 1	Protein 2	Score	Precision	Evidence
NUP43	XPA	0.408	0.567	bioplex (XPA) bioplex_WMM
ERCC4	XPA	0.028	0.229	bioplex (XPA) bioplex_WMM
NUP43	ERCC4	0.007	0.007	bioplex_WMM WMM_only

Images

Click to enlarge

Complex HuMAP2_03411 has an average edge precision of 0.268 which is ranked 5078 out of all 6965 complexes.

Related Complexes

Genename	Complexes
ERCC4	HuMAP2_00595 HuMAP2_00777 HuMAP2_02823 HuMAP2_03411 HuMAP2_04070 HuMAP2_04705 HuMAP2_05771
XPA	HuMAP2_00777 HuMAP2_02823 HuMAP2_03411 HuMAP2_04705 HuMAP2_04997 HuMAP2_05771
NUP43	HuMAP2_00541 HuMAP2_03411 HuMAP2_04705 HuMAP2_04997 HuMAP2_05315

hu.MAP 2.0: Complex View

Search for a protein

Complex: HuMAP2_03411