hu.MAP 2.0: Complex View
Human Protein Complex Map
Search for a protein
Complex: HuMAP2_03463
Confidence: Medium
Proteins| Genename | Protein Name | Links |
|---|---|---|
| LAGE3 | EKC/KEOPS complex subunit LAGE3 (L antigen family member 3) (Protein ESO-3) (Protein ITBA2) | UniProt NCBI |
| TPRKB | EKC/KEOPS complex subunit TPRKB (PRPK-binding protein) (TP53RK-binding protein) | UniProt NCBI |
| TP53RK | EKC/KEOPS complex subunit TP53RK (EC 3.6.-.-) (Atypical serine/threonine protein kinase TP53RK) (Nori-2) (TP53-regulating kinase) (EC 2.7.11.1) (p53-related protein kinase) | UniProt NCBI |
| HYKK | Hydroxylysine kinase (5-hydroxy-L-lysine kinase) (EC 2.7.1.81) (Aminoglycoside phosphotransferase domain-containing protein 1) | UniProt NCBI |
| GON7 | EKC/KEOPS complex subunit GON7 | UniProt NCBI |
| OSGEP | Probable tRNA N6-adenosine threonylcarbamoyltransferase (EC 2.3.1.234) (N6-L-threonylcarbamoyladenine synthase) (t(6)A synthase) (O-sialoglycoprotein endopeptidase) (hOSGEP) (t(6)A37 threonylcarbamoyladenosine biosynthesis protein OSGEP) (tRNA threonylcarbamoyladenosine biosynthesis protein OSGEP) | UniProt NCBI |
Enrichments
| Term ID | Corrected Pval | Fraction Complex Coverage | Proteins | Term Name |
|---|---|---|---|---|
| GO:0000408 | 2.94892899195e-13 | 0.833333333333 | GON7 LAGE3 OSGEP TP53RK TPRKB | EKC/KEOPS complex |
| CORUM:7555 | 4.54011687692e-13 | 0.666666666667 | TP53RK LAGE3 OSGEP TPRKB | KEOPS complex |
| HP:0100720 | 2.90432688754e-09 | 0.666666666667 | TP53RK LAGE3 OSGEP TPRKB | Hypoplasia of the ear cartilage |
| HP:0002410 | 9.66339276914e-09 | 0.666666666667 | TP53RK LAGE3 OSGEP TPRKB | Aqueductal stenosis |
| HP:0002036 | 5.13179769093e-08 | 0.666666666667 | TP53RK LAGE3 OSGEP TPRKB | Hiatus hernia |
| REAC:R-HSA-6782315 | 1.21019310036e-07 | 0.666666666667 | TP53RK LAGE3 OSGEP TPRKB | tRNA modification in the nucleus and cytosol |
| HP:0005108 | 1.65859670835e-07 | 0.666666666667 | TP53RK LAGE3 OSGEP TPRKB | Abnormality of the intervertebral disk |
| GO:0070525 | 2.61389419879e-07 | 0.666666666667 | TP53RK LAGE3 OSGEP TPRKB | tRNA threonylcarbamoyladenosine metabolic process |
| HP:0000096 | 1.01095018146e-06 | 0.666666666667 | TP53RK LAGE3 OSGEP TPRKB | Glomerulosclerosis |
| HP:0003774 | 2.73478159832e-06 | 0.666666666667 | TP53RK LAGE3 OSGEP TPRKB | Stage 5 chronic kidney disease |
| HP:0001181 | 2.91090531126e-06 | 0.666666666667 | TP53RK LAGE3 OSGEP TPRKB | Adducted thumb |
| REAC:R-HSA-72306 | 5.04501738419e-06 | 0.666666666667 | TP53RK LAGE3 OSGEP TPRKB | tRNA processing |
| HP:0000601 | 5.45924295507e-06 | 0.666666666667 | TP53RK LAGE3 OSGEP TPRKB | Hypotelorism |
| HP:0012622 | 6.3781831231e-06 | 0.666666666667 | TP53RK LAGE3 OSGEP TPRKB | Chronic kidney disease |
| HP:0000112 | 8.96979408236e-06 | 0.666666666667 | TP53RK LAGE3 OSGEP TPRKB | Nephropathy |
| HP:0000100 | 2.15468843809e-05 | 0.666666666667 | TP53RK LAGE3 OSGEP TPRKB | Nephrotic syndrome |
| HP:0001622 | 2.15468843809e-05 | 0.666666666667 | TP53RK LAGE3 OSGEP TPRKB | Premature birth |
| HP:0001302 | 2.4071709399e-05 | 0.666666666667 | TP53RK LAGE3 OSGEP TPRKB | Pachygyria |
| HP:0000095 | 3.88938058743e-05 | 0.666666666667 | TP53RK LAGE3 OSGEP TPRKB | Abnormality of renal glomerulus morphology |
| HP:0031263 | 3.88938058743e-05 | 0.666666666667 | TP53RK LAGE3 OSGEP TPRKB | Abnormal renal corpuscle morphology |
| HP:0001339 | 4.4164150935e-05 | 0.666666666667 | TP53RK LAGE3 OSGEP TPRKB | Lissencephaly |
| HP:0000093 | 5.46507595876e-05 | 0.666666666667 | TP53RK LAGE3 OSGEP TPRKB | Proteinuria |
| HP:0020129 | 6.88013713711e-05 | 0.666666666667 | TP53RK LAGE3 OSGEP TPRKB | Abnormal urine protein level |
| HP:0011035 | 7.47568100119e-05 | 0.666666666667 | TP53RK LAGE3 OSGEP TPRKB | Abnormal renal cortex morphology |
| HP:0100490 | 9.74218743439e-05 | 0.666666666667 | TP53RK LAGE3 OSGEP TPRKB | Camptodactyly of finger |
| HP:0001220 | 0.000102509517863 | 0.666666666667 | TP53RK LAGE3 OSGEP TPRKB | Interphalangeal joint contracture of finger |
| HP:0000400 | 0.000113278114764 | 0.666666666667 | TP53RK LAGE3 OSGEP TPRKB | Macrotia |
| HP:0006261 | 0.000121893303902 | 0.666666666667 | TP53RK LAGE3 OSGEP TPRKB | Abnormal phalangeal joint morphology of the hand |
| HP:0012575 | 0.000130989268402 | 0.666666666667 | TP53RK LAGE3 OSGEP TPRKB | Abnormal nephron morphology |
| HP:0004374 | 0.000137328933791 | 0.666666666667 | TP53RK LAGE3 OSGEP TPRKB | Hemiplegia/hemiparesis |
| HP:0012785 | 0.000140583431348 | 0.666666666667 | TP53RK LAGE3 OSGEP TPRKB | Flexion contracture of finger |
| CORUM:7556 | 0.000176032589326 | 0.333333333333 | LAGE3 OSGEP | PRAME complex |
| HP:0009473 | 0.000252372828604 | 0.666666666667 | TP53RK LAGE3 OSGEP TPRKB | Joint contracture of the hand |
| HP:0012385 | 0.000391137247354 | 0.666666666667 | TP53RK LAGE3 OSGEP TPRKB | Camptodactyly |
| HP:0100360 | 0.000420118841457 | 0.666666666667 | TP53RK LAGE3 OSGEP TPRKB | Contractures of the joints of the upper limbs |
| HP:0030044 | 0.000516733741411 | 0.666666666667 | TP53RK LAGE3 OSGEP TPRKB | Flexion contracture of digit |
| HP:0002536 | 0.000713426757391 | 0.666666666667 | TP53RK LAGE3 OSGEP TPRKB | Abnormal cortical gyration |
| HP:0001172 | 0.000735779667636 | 0.666666666667 | TP53RK LAGE3 OSGEP TPRKB | Abnormal thumb morphology |
| HP:0000083 | 0.00106154285913 | 0.666666666667 | TP53RK LAGE3 OSGEP TPRKB | Renal insufficiency |
| HP:0003121 | 0.0011222448426 | 0.666666666667 | TP53RK LAGE3 OSGEP TPRKB | Limb joint contracture |
| HP:0002538 | 0.00120172004146 | 0.666666666667 | TP53RK LAGE3 OSGEP TPRKB | Abnormality of the cerebral cortex |
| HP:0002269 | 0.00188142954639 | 0.666666666667 | TP53RK LAGE3 OSGEP TPRKB | Abnormality of neuronal migration |
| HP:0002353 | 0.0025466367478 | 0.666666666667 | TP53RK LAGE3 OSGEP TPRKB | EEG abnormality |
| HP:0010549 | 0.00272219976405 | 0.666666666667 | TP53RK LAGE3 OSGEP TPRKB | Weakness due to upper motor neuron dysfunction |
| HP:0030178 | 0.00306728865182 | 0.666666666667 | TP53RK LAGE3 OSGEP TPRKB | Abnormality of central nervous system electrophysiology |
| HP:0009810 | 0.00310019879735 | 0.666666666667 | TP53RK LAGE3 OSGEP TPRKB | Abnormality of upper limb joint |
| HP:0100790 | 0.00355239731583 | 0.666666666667 | TP53RK LAGE3 OSGEP TPRKB | Hernia |
| HP:0001511 | 0.00362609362351 | 0.666666666667 | TP53RK LAGE3 OSGEP TPRKB | Intrauterine growth retardation |
| HP:0001967 | 0.00495018352279 | 0.333333333333 | TP53RK OSGEP | Diffuse mesangial sclerosis |
| HP:0002577 | 0.00510933828714 | 0.666666666667 | TP53RK LAGE3 OSGEP TPRKB | Abnormality of the stomach |
| HP:0001311 | 0.00630324726269 | 0.666666666667 | TP53RK LAGE3 OSGEP TPRKB | Abnormal nervous system electrophysiology |
| GO:0002949 | 0.00676235117068 | 0.333333333333 | OSGEP TPRKB | tRNA threonylcarbamoyladenosine modification |
| HP:0001966 | 0.00787106080828 | 0.333333333333 | TP53RK OSGEP | Mesangial abnormality |
| HP:0003110 | 0.00829469086856 | 0.666666666667 | TP53RK LAGE3 OSGEP TPRKB | Abnormality of urine homeostasis |
| REAC:R-HSA-8953854 | 0.00833913786065 | 0.666666666667 | TP53RK LAGE3 OSGEP TPRKB | Metabolism of RNA |
| HP:0005918 | 0.0105543324324 | 0.666666666667 | TP53RK LAGE3 OSGEP TPRKB | Abnormal finger phalanx morphology |
| HP:0100543 | 0.0105543324324 | 0.666666666667 | TP53RK LAGE3 OSGEP TPRKB | Cognitive impairment |
| HP:0012211 | 0.0106367575957 | 0.666666666667 | TP53RK LAGE3 OSGEP TPRKB | Abnormal renal physiology |
| HP:0000377 | 0.0115753226372 | 0.666666666667 | TP53RK LAGE3 OSGEP TPRKB | Abnormality of the pinna |
| HP:0000316 | 0.0117523615224 | 0.666666666667 | TP53RK LAGE3 OSGEP TPRKB | Hypertelorism |
| HP:0012444 | 0.0130485354289 | 0.666666666667 | TP53RK LAGE3 OSGEP TPRKB | Brain atrophy |
| HP:0000347 | 0.0134376051018 | 0.666666666667 | TP53RK LAGE3 OSGEP TPRKB | Micrognathia |
| HP:0001371 | 0.0136353370404 | 0.666666666667 | TP53RK LAGE3 OSGEP TPRKB | Flexion contracture |
| HP:0009118 | 0.0137350088779 | 0.666666666667 | TP53RK LAGE3 OSGEP TPRKB | Aplasia/Hypoplasia of the mandible |
| HP:0009116 | 0.0146565726179 | 0.666666666667 | TP53RK LAGE3 OSGEP TPRKB | Aplasia/Hypoplasia involving bones of the skull |
| HP:0100261 | 0.0151879552726 | 0.666666666667 | TP53RK LAGE3 OSGEP TPRKB | Abnormal tendon morphology |
| HP:0100807 | 0.0172629242154 | 0.5 | TP53RK OSGEP LAGE3 | Long fingers |
| HPA:015010_23 | 0.0183858567609 | 0.666666666667 | GON7 LAGE3 TPRKB TP53RK | epididymis; glandular cells[Approved,High] |
| HP:0002118 | 0.0221643816853 | 0.666666666667 | TP53RK LAGE3 OSGEP TPRKB | Abnormality of the cerebral ventricles |
| HP:0007367 | 0.0223072471294 | 0.666666666667 | TP53RK LAGE3 OSGEP TPRKB | Atrophy/Degeneration affecting the central nervous system |
| HP:0009122 | 0.0228855434819 | 0.666666666667 | TP53RK LAGE3 OSGEP TPRKB | Aplasia/hypoplasia affecting bones of the axial skeleton |
| HP:0001197 | 0.024687191507 | 0.666666666667 | TP53RK LAGE3 OSGEP TPRKB | Abnormality of prenatal development or birth |
| HP:0001257 | 0.0259452832381 | 0.666666666667 | TP53RK LAGE3 OSGEP TPRKB | Spasticity |
| HP:0000164 | 0.0310897526003 | 0.666666666667 | TP53RK LAGE3 OSGEP TPRKB | Abnormality of the dentition |
| HP:0000277 | 0.0331529578102 | 0.666666666667 | TP53RK LAGE3 OSGEP TPRKB | Abnormality of the mandible |
| HP:0100886 | 0.0353157942626 | 0.666666666667 | TP53RK LAGE3 OSGEP TPRKB | Abnormality of globe location |
| HP:0030791 | 0.0403953252718 | 0.666666666667 | TP53RK LAGE3 OSGEP TPRKB | Abnormal jaw morphology |
| HP:0012210 | 0.0424327328427 | 0.666666666667 | TP53RK LAGE3 OSGEP TPRKB | Abnormal renal morphology |
Edges
| Protein 1 | Protein 2 | Score | Precision | Evidence |
|---|---|---|---|---|
| LAGE3 | OSGEP | 1.0 | 0.949 | hein_WMM bioplex (OSGEP) bioplex_WMM boldt hein (OSGEP) fraction boldt_WMM |
| TP53RK | OSGEP | 1.0 | 0.949 | hein_WMM bioplex (OSGEP,TP53RK) bioplex_WMM boldt youn_WMM hein (OSGEP) boldt_WMM |
| TPRKB | OSGEP | 1.0 | 0.949 | hein_WMM bioplex (OSGEP) bioplex_WMM boldt hein (OSGEP) boldt_WMM |
| GON7 | OSGEP | 1.0 | 0.949 | hein_WMM bioplex (OSGEP) bioplex_WMM hein (OSGEP) |
| TP53RK | GON7 | 0.878 | 0.812 | hein_WMM bioplex (TP53RK) bioplex_WMM |
| TP53RK | TPRKB | 0.87 | 0.803 | hein_WMM bioplex (TP53RK) bioplex_WMM boldt boldt_WMM |
| TP53RK | LAGE3 | 0.55 | 0.643 | hein_WMM bioplex (TP53RK) bioplex_WMM boldt boldt_WMM |
| OSGEP | HYKK | 0.025 | 0.212 | bioplex (OSGEP) bioplex_WMM |
| LAGE3 | TPRKB | 0.021 | 0.188 | hein_WMM bioplex_WMM boldt boldt_WMM |
| TPRKB | GON7 | 0.013 | 0.149 | hein_WMM bioplex_WMM WMM_only |
| LAGE3 | GON7 | 0.011 | 0.14 | hein_WMM bioplex_WMM WMM_only |
| GON7 | HYKK | 0.009 | 0.108 | bioplex_WMM WMM_only |
| TPRKB | HYKK | 0.008 | 0.092 | bioplex_WMM WMM_only |
| LAGE3 | HYKK | 0.008 | 0.066 | bioplex_WMM WMM_only |
| TP53RK | HYKK | 0.007 | 0.005 | bioplex_WMM WMM_only |
Images
Click to enlarge
Complex HuMAP2_03463 has an average edge precision of 0.468 which is ranked 2729 out of all 6965 complexes.
Related Complexes