hu.MAP 2.0: Complex View

Human Protein Complex Map

Complex: HuMAP2_04832

Confidence: Medium

Genename	Protein Name	Links
SDHAF2	Succinate dehydrogenase assembly factor 2, mitochondrial (SDH assembly factor 2) (SDHAF2)	UniProt NCBI
PDZRN3	E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3 (EC 2.3.2.27) (Ligand of Numb protein X 3) (PDZ domain-containing RING finger protein 3) (RING-type E3 ubiquitin transferase PDZRN3) (Semaphorin cytoplasmic domain-associated protein 3) (Protein SEMACAP3)	UniProt NCBI
SDHAF3	Succinate dehydrogenase assembly factor 3, mitochondrial (SDH assembly factor 3) (SDHAF3)	UniProt NCBI
SDHA	Succinate dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein subunit, mitochondrial (EC 1.3.5.1) (Flavoprotein subunit of complex II) (Fp)	UniProt NCBI
FAM13C	Protein FAM13C	UniProt NCBI
SDHAF4	Succinate dehydrogenase assembly factor 4, mitochondrial (SDH assembly factor 4) (SDHAF4)	UniProt NCBI

Enrichments

Term ID	Corrected Pval	Fraction Complex Coverage	Proteins	Term Name
GO:0034552	7.26438828159e-06	0.5	SDHAF3 SDHAF2 SDHAF4	respiratory chain complex II assembly
GO:0034553	7.26438828159e-06	0.5	SDHAF3 SDHAF2 SDHAF4	mitochondrial respiratory chain complex II assembly
HP:0010532	0.00412589193299	0.333333333333	SDHA SDHAF2	Paroxysmal vertigo
HP:0008629	0.00412589193299	0.333333333333	SDHA SDHAF2	Pulsatile tinnitus
HP:0006737	0.00412589193299	0.333333333333	SDHA SDHAF2	Extraadrenal pheochromocytoma
HP:0003639	0.00412589193299	0.333333333333	SDHA SDHAF2	Elevated urinary epinephrine
HP:0002864	0.00412589193299	0.333333333333	SDHA SDHAF2	Paraganglioma of head and neck
HP:0000740	0.00412589193299	0.333333333333	SDHA SDHAF2	Episodic paroxysmal anxiety
HP:0003345	0.00495018352279	0.333333333333	SDHA SDHAF2	Elevated urinary norepinephrine
HP:0012222	0.00495018352279	0.333333333333	SDHA SDHAF2	Arachnoid hemangiomatosis
HP:0009711	0.00495018352279	0.333333333333	SDHA SDHAF2	Retinal capillary hemangioma
HP:0006748	0.00495018352279	0.333333333333	SDHA SDHAF2	Adrenal pheochromocytoma
HP:0003574	0.00495018352279	0.333333333333	SDHA SDHAF2	Positive regitine blocking test
HP:0001095	0.00495018352279	0.333333333333	SDHA SDHAF2	Hypertensive retinopathy
HP:0100642	0.00495018352279	0.333333333333	SDHA SDHAF2	Neoplasm of the adrenal medulla
HP:0011979	0.00584916901642	0.333333333333	SDHA SDHAF2	Elevated urinary dopamine
HP:0002331	0.00584916901642	0.333333333333	SDHA SDHAF2	Recurrent paroxysmal headache
HP:0002640	0.00584916901642	0.333333333333	SDHA SDHAF2	Hypertension associated with pheochromocytoma
GO:0000104	0.00676235117068	0.333333333333	SDHA SDHAF4	succinate dehydrogenase activity
GO:0008177	0.00676235117068	0.333333333333	SDHA SDHAF4	succinate dehydrogenase (ubiquinone) activity
HP:0010797	0.00682280818411	0.333333333333	SDHA SDHAF2	Hemangioblastoma
HP:0003528	0.00682280818411	0.333333333333	SDHA SDHAF2	Elevated calcitonin
HP:0002666	0.00787106080828	0.333333333333	SDHA SDHAF2	Pheochromocytoma
HP:0002668	0.00787106080828	0.333333333333	SDHA SDHAF2	Paraganglioma
HP:0031284	0.0101912456166	0.333333333333	SDHA SDHAF2	Flushing
HP:0009594	0.0101912456166	0.333333333333	SDHA SDHAF2	Retinal hamartoma
HP:0001069	0.0101912456166	0.333333333333	SDHA SDHAF2	Episodic hyperhidrosis
HP:0011703	0.0114630974264	0.333333333333	SDHA SDHAF2	Sinus tachycardia
HP:0011976	0.0142301190129	0.333333333333	SDHA SDHAF2	Elevated urinary catecholamines
HP:0011281	0.0142301190129	0.333333333333	SDHA SDHAF2	Abnormality of urine catecholamine concentration
HP:0030670	0.0172946302375	0.333333333333	SDHA SDHAF2	Hamartoma of the orbital region
HP:0010568	0.0172946302375	0.333333333333	SDHA SDHAF2	Hamartoma of the eye
HP:0001293	0.0172946302375	0.333333333333	SDHA SDHAF2	Cranial nerve compression
GO:0006121	0.020283420769	0.333333333333	SDHA SDHAF2	mitochondrial electron transport, succinate to ubiquinone
GO:0016635	0.020283420769	0.333333333333	SDHA SDHAF4	oxidoreductase activity, acting on the CH-CH group of donors, quinone or related compound as acceptor
HP:0100634	0.0262553193116	0.333333333333	SDHA SDHAF2	Neuroendocrine neoplasm
HP:0025269	0.0262553193116	0.333333333333	SDHA SDHAF2	Panic attack
HP:0032148	0.0282698926051	0.333333333333	SDHA SDHAF2	Episodic pain
HP:0031801	0.0282698926051	0.333333333333	SDHA SDHAF2	Vocal cord dysfunction
HP:0002574	0.0282698926051	0.333333333333	SDHA SDHAF2	Episodic abdominal pain
HP:0001605	0.0282698926051	0.333333333333	SDHA SDHAF2	Vocal cord paralysis
HP:0100631	0.030358517586	0.333333333333	SDHA SDHAF2	Neoplasm of the adrenal gland
HP:0100530	0.032521154219	0.333333333333	SDHA SDHAF2	Abnormal calcium-phosphate regulating hormone level
GO:0006105	0.0405595771497	0.333333333333	SDHAF3 SDHA	succinate metabolic process
GO:0045257	0.0405595771497	0.333333333333	SDHA SDHAF4	succinate dehydrogenase complex (ubiquinone)
GO:0045273	0.0405595771497	0.333333333333	SDHA SDHAF4	respiratory chain complex II
GO:0045281	0.0405595771497	0.333333333333	SDHA SDHAF4	succinate dehydrogenase complex
GO:0045283	0.0405595771497	0.333333333333	SDHA SDHAF4	fumarate reductase complex
GO:0005749	0.0405595771497	0.333333333333	SDHA SDHAF4	mitochondrial respiratory chain complex II, succinate dehydrogenase complex (ubiquinone)
HP:0000360	0.0419110169922	0.333333333333	SDHA SDHAF2	Tinnitus
HP:0000526	0.0419110169922	0.333333333333	SDHA SDHAF2	Aniridia
HP:0100012	0.0470489782673	0.333333333333	SDHA SDHAF2	Neoplasm of the eye

Edges

Protein 1	Protein 2	Score	Precision	Evidence
SDHAF2	SDHA	0.983	0.899	hein_WMM bioplex (SDHA) bioplex_WMM hein (SDHAF2)
SDHA	SDHAF4	0.939	0.85	bioplex (SDHA) bioplex_WMM fraction
SDHAF3	SDHAF4	0.178	0.436	bioplex (SDHAF3) bioplex_WMM
PDZRN3	SDHA	0.098	0.358	bioplex (SDHA) bioplex_WMM gupta_WMM boldt_WMM
FAM13C	PDZRN3	0.022	0.204	bioplex (FAM13C) bioplex_WMM
SDHAF2	SDHAF4	0.008	0.091	bioplex_WMM WMM_only
SDHAF2	SDHAF3	0.008	0.087	bioplex_WMM WMM_only
PDZRN3	SDHAF2	0.008	0.067	bioplex_WMM WMM_only
PDZRN3	SDHAF4	0.008	0.04	bioplex_WMM WMM_only
PDZRN3	SDHAF3	0.008	0.025	bioplex_WMM WMM_only
SDHA	SDHAF3	0.007	0.008	bioplex (SDHA,SDHAF3) bioplex_WMM
FAM13C	SDHA	0.007	0.005	bioplex (FAM13C)

Images

Click to enlarge

Complex HuMAP2_04832 has an average edge precision of 0.256 which is ranked 5289 out of all 6965 complexes.

Related Complexes

Genename	Complexes
SDHAF2	HuMAP2_03232 HuMAP2_04642 HuMAP2_04832 HuMAP2_05446
PDZRN3	HuMAP2_01087 HuMAP2_03232 HuMAP2_03997 HuMAP2_04832 HuMAP2_05446 HuMAP2_05666 HuMAP2_07016
SDHAF3	HuMAP2_04609 HuMAP2_04832 HuMAP2_05446
SDHA	HuMAP2_03232 HuMAP2_04642 HuMAP2_04832 HuMAP2_05446
FAM13C	HuMAP2_01087 HuMAP2_02645 HuMAP2_03997 HuMAP2_04832 HuMAP2_05282 HuMAP2_05666 HuMAP2_07016
SDHAF4	HuMAP2_04609 HuMAP2_04642 HuMAP2_04832 HuMAP2_05446

hu.MAP 2.0: Complex View

Search for a protein

Complex: HuMAP2_04832