hu.MAP 2.0: Complex View
Human Protein Complex Map
Search for a protein
Complex: HuMAP2_06286
Confidence: Medium
Proteins| Genename | Protein Name | Links |
|---|---|---|
| REV3L | DNA polymerase zeta catalytic subunit (EC 2.7.7.7) (Protein reversionless 3-like) (REV3-like) (hREV3) | UniProt NCBI |
| POLD4 | DNA polymerase delta subunit 4 (DNA polymerase delta subunit p12) | UniProt NCBI |
| POLD1 | DNA polymerase delta catalytic subunit (EC 2.7.7.7) (EC 3.1.11.-) (DNA polymerase subunit delta p125) | UniProt NCBI |
| AMZ1 | Archaemetzincin-1 (EC 3.4.-.-) (Archeobacterial metalloproteinase-like protein 1) | UniProt NCBI |
| POLD3 | DNA polymerase delta subunit 3 (DNA polymerase delta subunit C) (DNA polymerase delta subunit p66) (DNA polymerase delta subunit p68) | UniProt NCBI |
| POLD2 | DNA polymerase delta subunit 2 (DNA polymerase delta subunit p50) | UniProt NCBI |
Enrichments
| Term ID | Corrected Pval | Fraction Complex Coverage | Proteins | Term Name |
|---|---|---|---|---|
| CORUM:297 | 2.26981451009e-12 | 0.666666666667 | POLD1 POLD3 POLD4 POLD2 | PCNA-DNA polymerase delta complex |
| REAC:R-HSA-110313 | 8.07398960956e-11 | 0.833333333333 | REV3L POLD1 POLD3 POLD4 POLD2 | Translesion synthesis by Y family DNA polymerases bypasses lesions on DNA template |
| CORUM:1107 | 9.5280993066e-11 | 0.666666666667 | POLD1 POLD3 POLD4 POLD2 | DNA synthesome core complex |
| WP:WP186 | 1.49571373038e-10 | 0.666666666667 | POLD1 POLD3 POLD4 POLD2 | Homologous recombination |
| GO:0042575 | 2.14561866932e-10 | 0.833333333333 | REV3L POLD1 POLD3 POLD4 POLD2 | DNA polymerase complex |
| REAC:R-HSA-73893 | 2.46617285137e-10 | 0.833333333333 | REV3L POLD1 POLD3 POLD4 POLD2 | DNA Damage Bypass |
| REAC:R-HSA-174437 | 2.51791739053e-10 | 0.666666666667 | POLD1 POLD3 POLD4 POLD2 | Removal of the Flap Intermediate from the C-strand |
| CORUM:1098 | 3.24304491165e-10 | 0.666666666667 | POLD1 POLD3 POLD4 POLD2 | DNA synthesome complex (13 subunits) |
| GO:0043625 | 3.6593342028e-10 | 0.666666666667 | POLD1 POLD3 POLD4 POLD2 | delta DNA polymerase complex |
| REAC:R-HSA-174414 | 3.95630202777e-10 | 0.666666666667 | POLD1 POLD3 POLD4 POLD2 | Processive synthesis on the C-strand of the telomere |
| CORUM:1108 | 6.18993641784e-10 | 0.666666666667 | POLD1 POLD3 POLD4 POLD2 | DNA synthesome complex (15 subunits) |
| CORUM:1099 | 1.07903889482e-09 | 0.666666666667 | POLD1 POLD3 POLD4 POLD2 | DNA synthesome complex (17 subunits) |
| CORUM:1111 | 1.07903889482e-09 | 0.666666666667 | POLD1 POLD3 POLD4 POLD2 | DNA synthesome complex (17 subunits) |
| REAC:R-HSA-69109 | 1.19969130191e-09 | 0.666666666667 | POLD1 POLD3 POLD4 POLD2 | Leading Strand Synthesis |
| REAC:R-HSA-69166 | 1.19969130191e-09 | 0.666666666667 | POLD1 POLD3 POLD4 POLD2 | Removal of the Flap Intermediate |
| REAC:R-HSA-174411 | 1.19969130191e-09 | 0.666666666667 | POLD1 POLD3 POLD4 POLD2 | Polymerase switching on the C-strand of the telomere |
| REAC:R-HSA-69091 | 1.19969130191e-09 | 0.666666666667 | POLD1 POLD3 POLD4 POLD2 | Polymerase switching |
| REAC:R-HSA-5358565 | 1.19969130191e-09 | 0.666666666667 | POLD1 POLD3 POLD4 POLD2 | Mismatch repair (MMR) directed by MSH2:MSH6 (MutSalpha) |
| REAC:R-HSA-5358606 | 1.19969130191e-09 | 0.666666666667 | POLD1 POLD3 POLD4 POLD2 | Mismatch repair (MMR) directed by MSH2:MSH3 (MutSbeta) |
| GO:0003887 | 1.29312581721e-09 | 0.833333333333 | REV3L POLD1 POLD3 POLD4 POLD2 | DNA-directed DNA polymerase activity |
| REAC:R-HSA-69183 | 1.63576680419e-09 | 0.666666666667 | POLD1 POLD3 POLD4 POLD2 | Processive synthesis on the lagging strand |
| REAC:R-HSA-5358508 | 1.63576680419e-09 | 0.666666666667 | POLD1 POLD3 POLD4 POLD2 | Mismatch Repair |
| KEGG:03430 | 2.99419274505e-09 | 0.666666666667 | POLD1 POLD3 POLD4 POLD2 | Mismatch repair |
| GO:0034061 | 4.82439758657e-09 | 0.833333333333 | REV3L POLD1 POLD3 POLD4 POLD2 | DNA polymerase activity |
| REAC:R-HSA-69186 | 5.80295251537e-09 | 0.666666666667 | POLD1 POLD3 POLD4 POLD2 | Lagging Strand Synthesis |
| REAC:R-HSA-5651801 | 7.16758219917e-09 | 0.666666666667 | POLD1 POLD3 POLD4 POLD2 | PCNA-Dependent Long Patch Base Excision Repair |
| KEGG:03410 | 1.21475962261e-08 | 0.666666666667 | POLD1 POLD3 POLD4 POLD2 | Base excision repair |
| REAC:R-HSA-174417 | 1.27214964402e-08 | 0.666666666667 | POLD1 POLD3 POLD4 POLD2 | Telomere C-strand (Lagging Strand) Synthesis |
| REAC:R-HSA-110373 | 1.51430095798e-08 | 0.666666666667 | POLD1 POLD3 POLD4 POLD2 | Resolution of AP sites via the multiple-nucleotide patch replacement pathway |
| REAC:R-HSA-5696397 | 1.51430095798e-08 | 0.666666666667 | POLD1 POLD3 POLD4 POLD2 | Gap-filling DNA repair synthesis and ligation in GG-NER |
| KEGG:03030 | 1.98900494732e-08 | 0.666666666667 | POLD1 POLD3 POLD4 POLD2 | DNA replication |
| KEGG:03440 | 3.08457532346e-08 | 0.666666666667 | POLD1 POLD3 POLD4 POLD2 | Homologous recombination |
| GO:0019985 | 3.22787683477e-08 | 0.833333333333 | REV3L POLD1 POLD3 POLD4 POLD2 | translesion synthesis |
| REAC:R-HSA-110314 | 3.27882210208e-08 | 0.666666666667 | POLD1 POLD3 POLD4 POLD2 | Recognition of DNA damage by PCNA-containing replication complex |
| REAC:R-HSA-180786 | 3.27882210208e-08 | 0.666666666667 | POLD1 POLD3 POLD4 POLD2 | Extension of Telomeres |
| WP:WP466 | 3.37122762341e-08 | 0.666666666667 | POLD1 POLD3 POLD4 POLD2 | DNA Replication |
| REAC:R-HSA-5656169 | 3.76416846139e-08 | 0.666666666667 | POLD1 POLD3 POLD4 POLD2 | Termination of translesion DNA synthesis |
| REAC:R-HSA-69190 | 4.30144390958e-08 | 0.666666666667 | POLD1 POLD3 POLD4 POLD2 | DNA strand elongation |
| KEGG:03420 | 4.57986525811e-08 | 0.666666666667 | POLD1 POLD3 POLD4 POLD2 | Nucleotide excision repair |
| REAC:R-HSA-73933 | 6.26114845342e-08 | 0.666666666667 | POLD1 POLD3 POLD4 POLD2 | Resolution of Abasic Sites (AP sites) |
| GO:0000731 | 6.72200990848e-08 | 0.833333333333 | REV3L POLD1 POLD3 POLD4 POLD2 | DNA synthesis involved in DNA repair |
| GO:0006301 | 1.03878083327e-07 | 0.833333333333 | REV3L POLD1 POLD3 POLD4 POLD2 | postreplication repair |
| REAC:R-HSA-5696400 | 1.21019310036e-07 | 0.666666666667 | POLD1 POLD3 POLD4 POLD2 | Dual Incision in GG-NER |
| WP:WP4022 | 4.50738420864e-07 | 0.666666666667 | POLD1 POLD3 POLD4 POLD2 | Pyrimidine metabolism |
| REAC:R-HSA-6782210 | 7.57405773874e-07 | 0.666666666667 | POLD1 POLD3 POLD4 POLD2 | Gap-filling DNA repair synthesis and ligation in TC-NER |
| REAC:R-HSA-6782135 | 8.06984733932e-07 | 0.666666666667 | POLD1 POLD3 POLD4 POLD2 | Dual incision in TC-NER |
| REAC:R-HSA-5685942 | 8.06984733932e-07 | 0.666666666667 | POLD1 POLD3 POLD4 POLD2 | HDR through Homologous Recombination (HRR) |
| REAC:R-HSA-6781827 | 1.69781798539e-06 | 0.666666666667 | POLD1 POLD3 POLD4 POLD2 | Transcription-Coupled Nucleotide Excision Repair (TC-NER) |
| REAC:R-HSA-157579 | 1.97964398673e-06 | 0.666666666667 | POLD1 POLD3 POLD4 POLD2 | Telomere Maintenance |
| REAC:R-HSA-5696399 | 2.29512356464e-06 | 0.666666666667 | POLD1 POLD3 POLD4 POLD2 | Global Genome Nucleotide Excision Repair (GG-NER) |
| REAC:R-HSA-73884 | 2.64682448332e-06 | 0.666666666667 | POLD1 POLD3 POLD4 POLD2 | Base Excision Repair |
| GO:0006297 | 3.23372816466e-06 | 0.666666666667 | POLD1 POLD3 POLD4 POLD2 | nucleotide-excision repair, DNA gap filling |
| REAC:R-HSA-73894 | 4.35751112638e-06 | 0.833333333333 | REV3L POLD1 POLD3 POLD4 POLD2 | DNA Repair |
| GO:0043601 | 4.61861792183e-06 | 0.666666666667 | POLD1 POLD3 POLD4 POLD2 | nuclear replisome |
| GO:0016779 | 6.26212265329e-06 | 0.833333333333 | REV3L POLD1 POLD3 POLD4 POLD2 | nucleotidyltransferase activity |
| REAC:R-HSA-73886 | 6.35809703042e-06 | 0.666666666667 | POLD1 POLD3 POLD4 POLD2 | Chromosome Maintenance |
| GO:0030894 | 6.40626927361e-06 | 0.666666666667 | POLD1 POLD3 POLD4 POLD2 | replisome |
| GO:0032201 | 6.40626927361e-06 | 0.666666666667 | POLD1 POLD3 POLD4 POLD2 | telomere maintenance via semi-conservative replication |
| REAC:R-HSA-5696398 | 6.84789868567e-06 | 0.666666666667 | POLD1 POLD3 POLD4 POLD2 | Nucleotide Excision Repair |
| GO:0016035 | 7.26438828159e-06 | 0.5 | REV3L POLD2 POLD3 | zeta DNA polymerase complex |
| REAC:R-HSA-69239 | 9.09450019206e-06 | 0.666666666667 | POLD1 POLD3 POLD4 POLD2 | Synthesis of DNA |
| GO:0006298 | 1.14807138073e-05 | 0.666666666667 | POLD1 POLD3 POLD4 POLD2 | mismatch repair |
| REAC:R-HSA-69306 | 1.18518696073e-05 | 0.666666666667 | POLD1 POLD3 POLD4 POLD2 | DNA Replication |
| GO:0006261 | 1.24105644798e-05 | 0.833333333333 | REV3L POLD1 POLD3 POLD4 POLD2 | DNA-dependent DNA replication |
| REAC:R-HSA-5693567 | 1.3444306072e-05 | 0.666666666667 | POLD1 POLD3 POLD4 POLD2 | HDR through Homologous Recombination (HRR) or Single Strand Annealing (SSA) |
| REAC:R-HSA-5693538 | 1.61264536488e-05 | 0.666666666667 | POLD1 POLD3 POLD4 POLD2 | Homology Directed Repair |
| GO:0042769 | 2.14812534311e-05 | 0.666666666667 | POLD1 POLD3 POLD4 POLD2 | DNA damage response, detection of DNA damage |
| GO:0071897 | 2.26451406257e-05 | 0.833333333333 | REV3L POLD1 POLD3 POLD4 POLD2 | DNA biosynthetic process |
| GO:0006296 | 2.40824494048e-05 | 0.666666666667 | POLD1 POLD3 POLD4 POLD2 | nucleotide-excision repair, DNA incision, 5'-to lesion |
| GO:0033683 | 2.99853000209e-05 | 0.666666666667 | POLD1 POLD3 POLD4 POLD2 | nucleotide-excision repair, DNA incision |
| REAC:R-HSA-69242 | 3.02487101892e-05 | 0.666666666667 | POLD1 POLD3 POLD4 POLD2 | S Phase |
| REAC:R-HSA-5693532 | 3.42582751834e-05 | 0.666666666667 | POLD1 POLD3 POLD4 POLD2 | DNA Double-Strand Break Repair |
| GO:0043596 | 3.69108895609e-05 | 0.666666666667 | POLD1 POLD3 POLD4 POLD2 | nuclear replication fork |
| GO:0140097 | 6.28582159941e-05 | 0.833333333333 | REV3L POLD1 POLD3 POLD4 POLD2 | catalytic activity, acting on DNA |
| GO:0033260 | 9.85570254489e-05 | 0.666666666667 | POLD1 POLD3 POLD4 POLD2 | nuclear DNA replication |
| GO:0044786 | 0.000133653758006 | 0.666666666667 | POLD1 POLD3 POLD4 POLD2 | cell cycle DNA replication |
| GO:0006260 | 0.000150202934951 | 0.833333333333 | REV3L POLD1 POLD3 POLD4 POLD2 | DNA replication |
| GO:0061695 | 0.000213275731053 | 0.833333333333 | REV3L POLD1 POLD3 POLD4 POLD2 | transferase complex, transferring phosphorus-containing groups |
| GO:0005657 | 0.000231008761032 | 0.666666666667 | POLD1 POLD3 POLD4 POLD2 | replication fork |
| GO:0006283 | 0.000395345440439 | 0.666666666667 | POLD1 POLD3 POLD4 POLD2 | transcription-coupled nucleotide-excision repair |
| GO:0006289 | 0.00173031461284 | 0.666666666667 | POLD1 POLD3 POLD4 POLD2 | nucleotide-excision repair |
| REAC:R-HSA-69278 | 0.00331294271573 | 0.666666666667 | POLD1 POLD3 POLD4 POLD2 | Cell Cycle, Mitotic |
| GO:0090305 | 0.0038519413587 | 0.666666666667 | POLD1 POLD3 POLD4 POLD2 | nucleic acid phosphodiester bond hydrolysis |
| GO:0032993 | 0.00506594708818 | 0.666666666667 | POLD1 POLD3 POLD4 POLD2 | protein-DNA complex |
| REAC:R-HSA-1640170 | 0.00675311119139 | 0.666666666667 | POLD1 POLD3 POLD4 POLD2 | Cell Cycle |
| GO:0000723 | 0.00729807142385 | 0.666666666667 | POLD1 POLD3 POLD4 POLD2 | telomere maintenance |
| GO:0006281 | 0.00761654730624 | 0.833333333333 | REV3L POLD1 POLD3 POLD4 POLD2 | DNA repair |
| GO:0051606 | 0.00790339487449 | 0.666666666667 | POLD1 POLD3 POLD4 POLD2 | detection of stimulus |
| GO:0032200 | 0.0101950303288 | 0.666666666667 | POLD1 POLD3 POLD4 POLD2 | telomere organization |
Edges
| Protein 1 | Protein 2 | Score | Precision | Evidence |
|---|---|---|---|---|
| POLD1 | POLD2 | 0.998 | 0.945 | hein_WMM bioplex (POLD2) bioplex_WMM youn_WMM hein (POLD1) Malo fraction |
| POLD2 | POLD4 | 0.956 | 0.862 | hein_WMM bioplex (POLD2) bioplex_WMM |
| POLD2 | REV3L | 0.454 | 0.595 | bioplex (POLD2) bioplex_WMM |
| POLD2 | POLD3 | 0.061 | 0.336 | hein_WMM bioplex (POLD2) bioplex_WMM youn_WMM fraction |
| AMZ1 | POLD2 | 0.06 | 0.337 | bioplex (AMZ1) bioplex_WMM |
| POLD1 | POLD4 | 0.018 | 0.176 | hein_WMM bioplex_WMM hein (POLD1) |
| POLD4 | REV3L | 0.009 | 0.095 | bioplex_WMM WMM_only |
| POLD4 | POLD3 | 0.009 | 0.093 | hein_WMM bioplex_WMM WMM_only |
| POLD1 | REV3L | 0.008 | 0.028 | bioplex_WMM gupta_WMM WMM_only |
| REV3L | POLD3 | 0.007 | 0.003 | bioplex_WMM WMM_only |
| AMZ1 | POLD3 | 0.004 | 0.009 | bioplex (AMZ1) bioplex_WMM |
| POLD1 | POLD3 | 0.004 | 0.016 | hein_WMM bioplex_WMM boldt youn_WMM hein (POLD1) fraction boldt_WMM |
Images
Click to enlarge
Complex HuMAP2_06286 has an average edge precision of 0.291 which is ranked 4733 out of all 6965 complexes.
Related Complexes
| Genename | Complexes |
|---|---|
| REV3L | HuMAP2_02230 HuMAP2_05209 HuMAP2_06286 |
| POLD4 | HuMAP2_02230 HuMAP2_05209 HuMAP2_05819 HuMAP2_06286 |
| POLD1 | HuMAP2_00586 HuMAP2_03648 HuMAP2_05209 HuMAP2_05819 HuMAP2_06286 |
| AMZ1 | HuMAP2_00378 HuMAP2_02230 HuMAP2_06286 HuMAP2_06838 |
| POLD3 | HuMAP2_02230 HuMAP2_05209 HuMAP2_06286 |
| POLD2 | HuMAP2_02230 HuMAP2_05209 HuMAP2_05819 HuMAP2_06286 |